Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAD1O00515 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAD1O00515 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAD1O00515 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAD1O00515 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAD1O00515 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAD1O00515 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAD1O00515 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAD1O00515 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAD1O00515 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAD1O00515 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAD1O00515 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAD1O00515 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAD1O00515 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAD1O00515 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAD1O00515 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAD1O00515 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAD1O00515 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAD1O00515 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAD1O00515 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAD1O00515 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAD1O00515 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAD1O00515 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAD1O00515 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAD1O00515 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAD1O00515 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAD1O00515 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAD1O00515 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LAD1O00515 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAD1O00515 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAD1O00515 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAD1O00515 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAD1O00515 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAD1O00515 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAD1O00515 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAD1O00515 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAD1O00515 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAD1O00515 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAD1O00515 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAD1O00515 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LAD1O00515 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAD1O00515 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAD1O00515 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAD1O00515 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAD1O00515 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAD1O00515 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LAD1O00515 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LAD1O00515 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LAD1O00515 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LAD1O00515 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LAD1O00515 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LAD1O00515 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LAD1O00515 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LAD1O00515 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LAD1O00515 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAD1O00515 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAD1O00515 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAD1O00515 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LAD1O00515 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LAD1O00515 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAD1O00515 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAD1O00515 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAD1O00515 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAD1O00515 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAD1O00515 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAD1O00515 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAD1O00515 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAD1O00515 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAD1O00515 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAD1O00515 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAD1O00515 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAD1O00515 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAD1O00515 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAD1O00515 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAD1O00515 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LAD1O00515 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAD1O00515 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAD1O00515 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAD1O00515 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAD1O00515 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAD1O00515 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAD1O00515 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAD1O00515 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAD1O00515 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAD1O00515 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAD1O00515 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAD1O00515 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAD1O00515 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LAD1O00515 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAD1O00515 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAD1O00515 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAD1O00515 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAD1O00515 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAD1O00515 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAD1O00515 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAD1O00515 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAD1O00515 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAD1O00515 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAD1O00515 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAD1O00515 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms