Protein–RNA interactions for Protein: O00409

FOXN3, Forkhead box protein N3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3O00409 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXN3O00409 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXN3O00409 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXN3O00409 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXN3O00409 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXN3O00409 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXN3O00409 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXN3O00409 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXN3O00409 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXN3O00409 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXN3O00409 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXN3O00409 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXN3O00409 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXN3O00409 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXN3O00409 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms