Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVT8

TMUB1, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB1Q9BVT8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMUB1Q9BVT8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMUB1Q9BVT8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMUB1Q9BVT8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMUB1Q9BVT8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMUB1Q9BVT8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMUB1Q9BVT8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMUB1Q9BVT8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMUB1Q9BVT8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMUB1Q9BVT8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMUB1Q9BVT8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMUB1Q9BVT8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMUB1Q9BVT8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMUB1Q9BVT8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMUB1Q9BVT8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMUB1Q9BVT8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMUB1Q9BVT8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMUB1Q9BVT8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMUB1Q9BVT8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMUB1Q9BVT8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMUB1Q9BVT8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMUB1Q9BVT8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMUB1Q9BVT8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMUB1Q9BVT8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMUB1Q9BVT8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMUB1Q9BVT8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMUB1Q9BVT8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMUB1Q9BVT8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMUB1Q9BVT8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMUB1Q9BVT8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMUB1Q9BVT8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMUB1Q9BVT8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMUB1Q9BVT8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMUB1Q9BVT8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMUB1Q9BVT8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMUB1Q9BVT8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMUB1Q9BVT8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMUB1Q9BVT8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMUB1Q9BVT8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMUB1Q9BVT8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMUB1Q9BVT8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMUB1Q9BVT8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMUB1Q9BVT8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMUB1Q9BVT8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMUB1Q9BVT8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMUB1Q9BVT8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMUB1Q9BVT8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMUB1Q9BVT8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMUB1Q9BVT8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMUB1Q9BVT8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMUB1Q9BVT8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMUB1Q9BVT8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMUB1Q9BVT8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMUB1Q9BVT8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMUB1Q9BVT8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMUB1Q9BVT8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMUB1Q9BVT8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMUB1Q9BVT8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMUB1Q9BVT8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMUB1Q9BVT8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMUB1Q9BVT8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMUB1Q9BVT8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMUB1Q9BVT8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMUB1Q9BVT8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMUB1Q9BVT8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMUB1Q9BVT8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMUB1Q9BVT8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMUB1Q9BVT8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMUB1Q9BVT8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMUB1Q9BVT8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMUB1Q9BVT8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMUB1Q9BVT8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMUB1Q9BVT8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMUB1Q9BVT8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMUB1Q9BVT8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMUB1Q9BVT8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMUB1Q9BVT8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMUB1Q9BVT8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMUB1Q9BVT8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMUB1Q9BVT8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMUB1Q9BVT8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMUB1Q9BVT8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMUB1Q9BVT8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMUB1Q9BVT8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMUB1Q9BVT8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMUB1Q9BVT8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMUB1Q9BVT8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMUB1Q9BVT8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMUB1Q9BVT8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMUB1Q9BVT8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMUB1Q9BVT8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMUB1Q9BVT8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMUB1Q9BVT8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMUB1Q9BVT8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMUB1Q9BVT8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TMUB1Q9BVT8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMUB1Q9BVT8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMUB1Q9BVT8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMUB1Q9BVT8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMUB1Q9BVT8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms