Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.142e-8■■■■■ 81.7
PCBP2Q15366 NUBPL-203ENST00000547839 2001 ntTSL 28.17□□□□□ -1.12e-8■■■■■ 81.7
PCBP2Q15366 NUBPL-210ENST00000551314 567 ntTSL 47.4□□□□□ -1.222e-8■■■■■ 81.7
PCBP2Q15366 NUBPL-205ENST00000549838 556 ntTSL 52.53□□□□□ -22e-8■■■■■ 81.7
PCBP2Q15366 PDLIM5-206ENST00000437932 5713 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.591e-6■■■■■ 81.2
PCBP2Q15366 PDLIM5-223ENST00000627587 1853 ntTSL 29.26□□□□□ -0.931e-6■■■■■ 81.2
PCBP2Q15366 PDLIM5-222ENST00000615540 6219 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.011e-6■■■■■ 81.2
PCBP2Q15366 PDLIM5-207ENST00000503974 2081 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.021e-6■■■■■ 81.2
PCBP2Q15366 PDLIM5-209ENST00000506632 907 ntTSL 38.47□□□□□ -1.051e-6■■■■■ 81.2
PCBP2Q15366 PDLIM5-201ENST00000317968 6083 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.071e-6■■■■■ 81.2
PCBP2Q15366 PDLIM5-204ENST00000380176 3098 ntTSL 1 (best)7.84□□□□□ -1.151e-6■■■■■ 81.2
PCBP2Q15366 PDLIM5-221ENST00000542407 2979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.191e-6■■■■■ 81.2
PCBP2Q15366 PDLIM5-219ENST00000514743 3356 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.281e-6■■■■■ 81.2
PCBP2Q15366 YTHDC2-201ENST00000161863 6316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.673e-7■■■■■ 81.1
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PCBP2Q15366 UBE2G2-211ENST00000497630 933 ntTSL 217.73■□□□□ 0.431e-23■■■■■ 81
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PCBP2Q15366 UBE2G2-204ENST00000477954 1034 ntTSL 314.6□□□□□ -0.071e-23■■■■■ 81
PCBP2Q15366 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.161e-23■■■■■ 81
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PCBP2Q15366 UBE2G2-210ENST00000496395 288 ntTSL 56.34□□□□□ -1.391e-23■■■■■ 81
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PCBP2Q15366 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.349e-9■■■■■ 80.9
PCBP2Q15366 AC010531.4-201ENST00000570286 576 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.389e-9■■■■■ 80.9
PCBP2Q15366 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.469e-9■■■■■ 80.9
PCBP2Q15366 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.761e-22■■■■■ 80.6
PCBP2Q15366 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.381e-22■■■■■ 80.6
PCBP2Q15366 GPBP1-202ENST00000309096 1385 ntTSL 25.85□□□□□ -1.476e-11■■■■■ 80.3
PCBP2Q15366 WNK2-203ENST00000411624 6679 ntTSL 1 (best)15.48■□□□□ 0.075e-7■■■■■ 80.2
PCBP2Q15366 U2AF2-208ENST00000592874 849 ntTSL 515.26■□□□□ 0.031e-15■■■■■ 80
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PCBP2Q15366 RER1-201ENST00000306256 695 ntTSL 518.89■□□□□ 0.613e-9■■■■■ 79.9
PCBP2Q15366 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.163e-9■■■■■ 79.9
PCBP2Q15366 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -03e-9■■■■■ 79.9
PCBP2Q15366 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.033e-9■■■■■ 79.9
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PCBP2Q15366 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.364e-30■■■■■ 79.9
PCBP2Q15366 RFWD3-202ENST00000571750 3033 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.434e-30■■■■■ 79.9
PCBP2Q15366 RFWD3-212ENST00000576652 528 ntTSL 49.49□□□□□ -0.894e-30■■■■■ 79.9
PCBP2Q15366 RFWD3-211ENST00000575397 841 ntTSL 29.29□□□□□ -0.924e-30■■■■■ 79.9
PCBP2Q15366 RFWD3-206ENST00000572840 458 ntTSL 28.34□□□□□ -1.074e-30■■■■■ 79.9
PCBP2Q15366 GATAD2A-207ENST00000432704 570 ntTSL 417.4■□□□□ 0.388e-19■■■■■ 79.8
PCBP2Q15366 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.378e-19■■■■■ 79.8
PCBP2Q15366 WDR26-203ENST00000445239 784 ntTSL 55.24□□□□□ -1.577e-12■■■■■ 79.7
PCBP2Q15366 RAB5B-211ENST00000628569 496 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.375e-17■■■■■ 79.6
PCBP2Q15366 PUM2-211ENST00000446940 525 ntTSL 413.95□□□□□ -0.186e-17■■■■■ 79.6
PCBP2Q15366 YWHAE-202ENST00000466227 1377 ntTSL 59.5□□□□□ -0.892e-41■■■■■ 79.5
PCBP2Q15366 MAP4K4-220ENST00000627726 3135 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.91e-8■■■■■ 79.4
PCBP2Q15366 MAP4K4-203ENST00000347699 3792 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.211e-8■■■■■ 79.4
PCBP2Q15366 U2AF2-205ENST00000588850 637 ntTSL 214.46□□□□□ -0.094e-10■■■■■ 79.4
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PCBP2Q15366 LPP-216ENST00000484468 578 ntTSL 37.02□□□□□ -1.291e-10■■■■■ 78.9
PCBP2Q15366 RAB10-201ENST00000264710 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.434e-9■■■■■ 78.6
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PCBP2Q15366 INTS10-203ENST00000518424 556 ntTSL 418.86■□□□□ 0.613e-15■■■■■ 78.6
PCBP2Q15366 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.53e-15■■■■■ 78.6
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PCBP2Q15366 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.41e-22■■■■■ 78.5
PCBP2Q15366 RBPJ-228ENST00000514730 569 ntTSL 55.86□□□□□ -1.471e-22■■■■■ 78.5
PCBP2Q15366 RBPJ-209ENST00000504938 731 ntTSL 35.74□□□□□ -1.491e-22■■■■■ 78.5
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PCBP2Q15366 RBPJ-231ENST00000515573 698 ntTSL 54.07□□□□□ -1.761e-22■■■■■ 78.5
PCBP2Q15366 TUFT1-207ENST00000498606 683 ntTSL 217.4■□□□□ 0.382e-17■■■■■ 78.5
PCBP2Q15366 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.032e-17■■■■■ 78.5
PCBP2Q15366 TUFT1-202ENST00000368848 3033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.452e-17■■■■■ 78.5
PCBP2Q15366 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC12.17□□□□□ -0.462e-17■■■■■ 78.5
PCBP2Q15366 TUFT1-204ENST00000392712 2946 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.592e-17■■■■■ 78.5
PCBP2Q15366 TUFT1-203ENST00000368849 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.862e-17■■■■■ 78.5
PCBP2Q15366 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.181e-14■■■■■ 78.4
PCBP2Q15366 RRM1-210ENST00000532170 3166 ntTSL 26.93□□□□□ -1.32e-12■■■■■ 78.4
PCBP2Q15366 RRM1-212ENST00000533349 2863 ntTSL 26.42□□□□□ -1.382e-12■■■■■ 78.4
PCBP2Q15366 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.522e-12■■■■■ 78.4
PCBP2Q15366 RRM1-203ENST00000526350 583 ntTSL 25.05□□□□□ -1.62e-12■■■■■ 78.4
PCBP2Q15366 RRM1-204ENST00000526865 562 ntTSL 44.02□□□□□ -1.772e-12■■■■■ 78.4
PCBP2Q15366 RRM1-211ENST00000532710 549 ntTSL 43.36□□□□□ -1.872e-12■■■■■ 78.4
PCBP2Q15366 KANSL1-213ENST00000576248 452 ntTSL 33.6□□□□□ -1.831e-7■■■■■ 78.2
PCBP2Q15366 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.781e-10■■■■■ 77.9
PCBP2Q15366 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.691e-10■■■■■ 77.9
PCBP2Q15366 UBE2F-212ENST00000439338 873 ntTSL 519.28■□□□□ 0.681e-10■■■■■ 77.9
PCBP2Q15366 UBE2F-206ENST00000416292 552 ntTSL 219.28■□□□□ 0.681e-10■■■■■ 77.9
PCBP2Q15366 UBE2F-217ENST00000448502 561 ntTSL 418.59■□□□□ 0.571e-10■■■■■ 77.9
PCBP2Q15366 UBE2F-209ENST00000433568 574 ntTSL 418.48■□□□□ 0.551e-10■■■■■ 77.9
PCBP2Q15366 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.551e-10■■■■■ 77.9
PCBP2Q15366 UBE2F-207ENST00000417231 984 ntTSL 518.42■□□□□ 0.541e-10■■■■■ 77.9
PCBP2Q15366 UBE2F-215ENST00000441728 1242 ntTSL 218.26■□□□□ 0.511e-10■■■■■ 77.9
PCBP2Q15366 UBE2F-218ENST00000454786 1292 ntTSL 515.68■□□□□ 0.11e-10■■■■■ 77.9
PCBP2Q15366 UBE2F-214ENST00000440223 830 ntTSL 315.57■□□□□ 0.081e-10■■■■■ 77.9
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