Protein–RNA interactions for Protein: Q06159

ATG39, Autophagy-related protein 39, yeastyeast

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG39Q06159 ALR1YOL130W 2580 nt7.44□□□□□ -1.22
ATG39Q06159 MTG2YHR168W 1557 nt7.44□□□□□ -1.22
ATG39Q06159 ALP1YNL270C 1722 nt7.44□□□□□ -1.22
ATG39Q06159 SED1YDR077W 1017 nt7.43□□□□□ -1.22
ATG39Q06159 YJL067WYJL067W 351 nt7.43□□□□□ -1.22
ATG39Q06159 YMR244WYMR244W 1068 nt7.43□□□□□ -1.22
ATG39Q06159 HXT1YHR094C 1713 nt7.43□□□□□ -1.22
ATG39Q06159 ZTA1YBR046C 1005 nt7.42□□□□□ -1.22
ATG39Q06159 YHR218WYHR218W 1812 nt7.41□□□□□ -1.22
ATG39Q06159 YGR012WYGR012W 1182 nt7.41□□□□□ -1.22
ATG39Q06159 LIP1YMR298W 453 nt7.41□□□□□ -1.22
ATG39Q06159 DBP1YPL119C 1854 nt7.41□□□□□ -1.22
ATG39Q06159 SFL1YOR140W 2301 nt7.4□□□□□ -1.22
ATG39Q06159 YRF1-2YER190W 5046 nt7.4□□□□□ -1.22
ATG39Q06159 YER190C-AYER190C-A 576 nt7.4□□□□□ -1.22
ATG39Q06159 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt7.4□□□□□ -1.22
ATG39Q06159 YLR111WYLR111W 333 nt7.4□□□□□ -1.22
ATG39Q06159 YLR279WYLR279W 390 nt7.4□□□□□ -1.22
ATG39Q06159 YML133W-AYML133W-A 576 nt7.4□□□□□ -1.22
ATG39Q06159 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt7.4□□□□□ -1.22
ATG39Q06159 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt7.4□□□□□ -1.22
ATG39Q06159 MEX67YPL169C 1800 nt7.4□□□□□ -1.23
ATG39Q06159 RAD23YEL037C 1197 nt7.39□□□□□ -1.23
ATG39Q06159 YMR226CYMR226C 804 nt7.37□□□□□ -1.23
ATG39Q06159 LPD1YFL018C 1500 nt7.37□□□□□ -1.23
ATG39Q06159 YBL086CYBL086C 1401 nt7.36□□□□□ -1.23
ATG39Q06159 YLR173WYLR173W 1827 nt7.36□□□□□ -1.23
ATG39Q06159 MSB4YOL112W 1479 nt7.36□□□□□ -1.23
ATG39Q06159 SAM1YLR180W 1149 nt7.35□□□□□ -1.23
ATG39Q06159 YOR325WYOR325W 474 nt7.35□□□□□ -1.23
ATG39Q06159 RSC8YFR037C 1674 nt7.35□□□□□ -1.23
ATG39Q06159 RTG2YGL252C 1767 nt7.33□□□□□ -1.24
ATG39Q06159 SGA1YIL099W 1650 nt7.33□□□□□ -1.24
ATG39Q06159 SHY1YGR112W 1170 nt7.33□□□□□ -1.24
ATG39Q06159 RBG2YGR173W 1107 nt7.32□□□□□ -1.24
ATG39Q06159 ARO8YGL202W 1503 nt7.32□□□□□ -1.24
ATG39Q06159 THI6YPL214C 1623 nt7.31□□□□□ -1.24
ATG39Q06159 UFD1YGR048W 1086 nt7.31□□□□□ -1.24
ATG39Q06159 TOA2YKL058W 369 nt7.31□□□□□ -1.24
ATG39Q06159 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt7.31□□□□□ -1.24
ATG39Q06159 YPL251WYPL251W 303 nt7.31□□□□□ -1.24
ATG39Q06159 BRR1YPR057W 1026 nt7.31□□□□□ -1.24
ATG39Q06159 KES1YPL145C 1305 nt7.3□□□□□ -1.24
ATG39Q06159 LEU9YOR108W 1815 nt7.3□□□□□ -1.24
ATG39Q06159 RIB3YDR487C 627 nt7.3□□□□□ -1.24
ATG39Q06159 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt7.3□□□□□ -1.24
ATG39Q06159 DAK2YFL053W 1776 nt7.29□□□□□ -1.24
ATG39Q06159 CAB5YDR196C 726 nt7.28□□□□□ -1.24
ATG39Q06159 URA6YKL024C 615 nt7.28□□□□□ -1.24
ATG39Q06159 OPI10YOL032W 741 nt7.28□□□□□ -1.24
ATG39Q06159 ZAP1YJL056C 2643 nt7.27□□□□□ -1.25
ATG39Q06159 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt7.26□□□□□ -1.25
ATG39Q06159 MCM5YLR274W 2328 nt7.26□□□□□ -1.25
ATG39Q06159 GND2YGR256W 1479 nt7.25□□□□□ -1.25
ATG39Q06159 YMR103CYMR103C 363 nt7.25□□□□□ -1.25
ATG39Q06159 LSB5YCL034W 1065 nt7.25□□□□□ -1.25
ATG39Q06159 UFO1YML088W 2007 nt7.25□□□□□ -1.25
ATG39Q06159 FIT1YDR534C 1587 nt7.25□□□□□ -1.25
ATG39Q06159 FCY21YER060W 1587 nt7.25□□□□□ -1.25
ATG39Q06159 CWC15YDR163W 528 nt7.24□□□□□ -1.25
ATG39Q06159 APT2YDR441C 546 nt7.24□□□□□ -1.25
ATG39Q06159 TRT2tT(CGU)K 72 nt7.24□□□□□ -1.25
ATG39Q06159 GND1YHR183W 1470 nt7.24□□□□□ -1.25
ATG39Q06159 OYE3YPL171C 1203 nt7.23□□□□□ -1.25
ATG39Q06159 GCD11YER025W 1584 nt7.23□□□□□ -1.25
ATG39Q06159 CCT2YIL142W 1584 nt7.21□□□□□ -1.25
ATG39Q06159 DUR3YHL016C 2208 nt7.21□□□□□ -1.26
ATG39Q06159 SAM2YDR502C 1155 nt7.2□□□□□ -1.26
ATG39Q06159 LOT5YKL183W 921 nt7.2□□□□□ -1.26
ATG39Q06159 PET8YNL003C 855 nt7.2□□□□□ -1.26
ATG39Q06159 SMM1YNR015W 1155 nt7.2□□□□□ -1.26
ATG39Q06159 ODC1YPL134C 933 nt7.2□□□□□ -1.26
ATG39Q06159 NBA1YOL070C 1506 nt7.2□□□□□ -1.26
ATG39Q06159 PRY1YJL079C 900 nt7.18□□□□□ -1.26
ATG39Q06159 BET2YPR176C 978 nt7.16□□□□□ -1.26
ATG39Q06159 MET30YIL046W 1923 nt7.16□□□□□ -1.26
ATG39Q06159 SEC61YLR378C 1443 nt7.16□□□□□ -1.26
ATG39Q06159 YNL190WYNL190W 615 nt7.15□□□□□ -1.26
ATG39Q06159 ADE2YOR128C 1716 nt7.15□□□□□ -1.27
ATG39Q06159 OXA1YER154W 1209 nt7.14□□□□□ -1.27
ATG39Q06159 HXT10YFL011W 1641 nt7.14□□□□□ -1.27
ATG39Q06159 YPI1YFR003C 468 nt7.14□□□□□ -1.27
ATG39Q06159 LSB3YFR024C-A 1380 nt7.14□□□□□ -1.27
ATG39Q06159 BNI5YNL166C 1347 nt7.14□□□□□ -1.27
ATG39Q06159 PHO23YNL097C 993 nt7.13□□□□□ -1.27
ATG39Q06159 ECM10YEL030W 1935 nt7.13□□□□□ -1.27
ATG39Q06159 LSB6YJL100W 1824 nt7.13□□□□□ -1.27
ATG39Q06159 CSM1YCR086W 573 nt7.12□□□□□ -1.27
ATG39Q06159 NUC1YJL208C 990 nt7.12□□□□□ -1.27
ATG39Q06159 SNU66YOR308C 1764 nt7.12□□□□□ -1.27
ATG39Q06159 QDR2YIL121W 1629 nt7.12□□□□□ -1.27
ATG39Q06159 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.11□□□□□ -1.27
ATG39Q06159 YER188WYER188W 720 nt7.1□□□□□ -1.27
ATG39Q06159 MIM1YOL026C 342 nt7.1□□□□□ -1.27
ATG39Q06159 SPP2YOR148C 558 nt7.1□□□□□ -1.27
ATG39Q06159 MSC1YML128C 1542 nt7.1□□□□□ -1.27
ATG39Q06159 VPS62YGR141W 1404 nt7.1□□□□□ -1.27
ATG39Q06159 MAM3YOL060C 2121 nt7.09□□□□□ -1.27
ATG39Q06159 DLD2YDL178W 1593 nt7.09□□□□□ -1.27
ATG39Q06159 VRG4YGL225W 1014 nt7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.2 ms