Protein–RNA interactions for Protein: Q03785

VHS1, Serine/threonine-protein kinase VHS1, yeastyeast

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1Q03785 NPP1YCR026C 2229 nt9.07□□□□□ -0.96
VHS1Q03785 FCY21YER060W 1587 nt9.06□□□□□ -0.96
VHS1Q03785 MAE1YKL029C 2010 nt9.05□□□□□ -0.96
VHS1Q03785 APT2YDR441C 546 nt9.05□□□□□ -0.96
VHS1Q03785 SAM2YDR502C 1155 nt9.05□□□□□ -0.96
VHS1Q03785 YPI1YFR003C 468 nt9.04□□□□□ -0.96
VHS1Q03785 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.04□□□□□ -0.96
VHS1Q03785 YJL067WYJL067W 351 nt9.04□□□□□ -0.96
VHS1Q03785 URA6YKL024C 615 nt9.04□□□□□ -0.96
VHS1Q03785 RIM8YGL045W 1629 nt9.04□□□□□ -0.96
VHS1Q03785 RPC82YPR190C 1965 nt9.04□□□□□ -0.96
VHS1Q03785 YEL008WYEL008W 381 nt9.02□□□□□ -0.97
VHS1Q03785 OYE3YPL171C 1203 nt9.02□□□□□ -0.97
VHS1Q03785 UFO1YML088W 2007 nt9.01□□□□□ -0.97
VHS1Q03785 PET8YNL003C 855 nt9.01□□□□□ -0.97
VHS1Q03785 PRY1YJL079C 900 nt8.99□□□□□ -0.97
VHS1Q03785 ESS1YJR017C 513 nt8.99□□□□□ -0.97
VHS1Q03785 GPN2YOR262W 1044 nt8.99□□□□□ -0.97
VHS1Q03785 SSN3YPL042C 1668 nt8.98□□□□□ -0.97
VHS1Q03785 CPD1YGR247W 720 nt8.98□□□□□ -0.97
VHS1Q03785 YGL114WYGL114W 2178 nt8.97□□□□□ -0.97
VHS1Q03785 HMG2YLR450W 3138 nt8.97□□□□□ -0.97
VHS1Q03785 LSB3YFR024C-A 1380 nt8.97□□□□□ -0.97
VHS1Q03785 CWC15YDR163W 528 nt8.96□□□□□ -0.98
VHS1Q03785 TPO4YOR273C 1980 nt8.95□□□□□ -0.98
VHS1Q03785 SEC61YLR378C 1443 nt8.95□□□□□ -0.98
VHS1Q03785 VRG4YGL225W 1014 nt8.93□□□□□ -0.98
VHS1Q03785 NUC1YJL208C 990 nt8.93□□□□□ -0.98
VHS1Q03785 BNI5YNL166C 1347 nt8.93□□□□□ -0.98
VHS1Q03785 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt8.92□□□□□ -0.98
VHS1Q03785 LSB5YCL034W 1065 nt8.92□□□□□ -0.98
VHS1Q03785 GID7YCL039W 2238 nt8.91□□□□□ -0.98
VHS1Q03785 CSM1YCR086W 573 nt8.9□□□□□ -0.98
VHS1Q03785 RIB2YOL066C 1776 nt8.89□□□□□ -0.99
VHS1Q03785 YJL055WYJL055W 738 nt8.89□□□□□ -0.99
VHS1Q03785 OXA1YER154W 1209 nt8.88□□□□□ -0.99
VHS1Q03785 PHO23YNL097C 993 nt8.88□□□□□ -0.99
VHS1Q03785 MUP1YGR055W 1725 nt8.88□□□□□ -0.99
VHS1Q03785 RSC8YFR037C 1674 nt8.88□□□□□ -0.99
VHS1Q03785 MSC1YML128C 1542 nt8.87□□□□□ -0.99
VHS1Q03785 RAS2YNL098C 969 nt8.87□□□□□ -0.99
VHS1Q03785 SPP2YOR148C 558 nt8.87□□□□□ -0.99
VHS1Q03785 DLD2YDL178W 1593 nt8.86□□□□□ -0.99
VHS1Q03785 YER188WYER188W 720 nt8.86□□□□□ -0.99
VHS1Q03785 FMS1YMR020W 1527 nt8.85□□□□□ -0.99
VHS1Q03785 FLR1YBR008C 1647 nt8.85□□□□□ -0.99
VHS1Q03785 ACO2YJL200C 2370 nt8.85□□□□□ -0.99
VHS1Q03785 HXT12YIL170W 1374 nt8.85□□□□□ -0.99
VHS1Q03785 RPT5YOR117W 1305 nt8.84□□□□□ -0.99
VHS1Q03785 NAP1YKR048C 1254 nt8.84□□□□□ -0.99
VHS1Q03785 FUB1YCR076C 753 nt8.83□□□□□ -1
VHS1Q03785 SEN2YLR105C 1134 nt8.83□□□□□ -1
VHS1Q03785 PUP1YOR157C 786 nt8.83□□□□□ -1
VHS1Q03785 YPS3YLR121C 1527 nt8.83□□□□□ -1
VHS1Q03785 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt8.82□□□□□ -1
VHS1Q03785 VPS62YGR141W 1404 nt8.81□□□□□ -1
VHS1Q03785 OSH7YHR001W 1314 nt8.8□□□□□ -1
VHS1Q03785 YJL118WYJL118W 660 nt8.8□□□□□ -1
VHS1Q03785 RIB7YBR153W 735 nt8.78□□□□□ -1
VHS1Q03785 OYE2YHR179W 1203 nt8.77□□□□□ -1.01
VHS1Q03785 HOL1YNR055C 1761 nt8.76□□□□□ -1.01
VHS1Q03785 SAM3YPL274W 1764 nt8.76□□□□□ -1.01
VHS1Q03785 PGC1YPL206C 966 nt8.76□□□□□ -1.01
VHS1Q03785 YBR232CYBR232C 360 nt8.76□□□□□ -1.01
VHS1Q03785 TPS1YBR126C 1488 nt8.76□□□□□ -1.01
VHS1Q03785 YOR325WYOR325W 474 nt8.75□□□□□ -1.01
VHS1Q03785 URA8YJR103W 1737 nt8.74□□□□□ -1.01
VHS1Q03785 ACH1YBL015W 1581 nt8.74□□□□□ -1.01
VHS1Q03785 SOL2YCR073W-A 948 nt8.74□□□□□ -1.01
VHS1Q03785 YDL086WYDL086W 822 nt8.74□□□□□ -1.01
VHS1Q03785 YNL024CYNL024C 741 nt8.74□□□□□ -1.01
VHS1Q03785 HEM13YDR044W 987 nt8.73□□□□□ -1.01
VHS1Q03785 ILV3YJR016C 1758 nt8.72□□□□□ -1.01
VHS1Q03785 LSM5YER146W 282 nt8.72□□□□□ -1.01
VHS1Q03785 EAF3YPR023C 1206 nt8.72□□□□□ -1.01
VHS1Q03785 GAL3YDR009W 1563 nt8.72□□□□□ -1.01
VHS1Q03785 CCT2YIL142W 1584 nt8.72□□□□□ -1.01
VHS1Q03785 PAU5YFL020C 369 nt8.7□□□□□ -1.02
VHS1Q03785 STP3YLR375W 1032 nt8.69□□□□□ -1.02
VHS1Q03785 ASP3-1YLR155C 1089 nt8.67□□□□□ -1.02
VHS1Q03785 ASP3-2YLR157C 1089 nt8.67□□□□□ -1.02
VHS1Q03785 ASP3-3YLR158C 1089 nt8.67□□□□□ -1.02
VHS1Q03785 ASP3-4YLR160C 1089 nt8.67□□□□□ -1.02
VHS1Q03785 DDI1YER143W 1287 nt8.66□□□□□ -1.02
VHS1Q03785 YJL064WYJL064W 396 nt8.66□□□□□ -1.02
VHS1Q03785 OPI10YOL032W 741 nt8.66□□□□□ -1.02
VHS1Q03785 TAT2YOL020W 1779 nt8.66□□□□□ -1.02
VHS1Q03785 BET2YPR176C 978 nt8.65□□□□□ -1.02
VHS1Q03785 CCT5YJR064W 1689 nt8.65□□□□□ -1.03
VHS1Q03785 PAU19YMR325W 375 nt8.64□□□□□ -1.03
VHS1Q03785 HIS2YFR025C 1008 nt8.63□□□□□ -1.03
VHS1Q03785 TMA23YMR269W 636 nt8.63□□□□□ -1.03
VHS1Q03785 YMR209CYMR209C 1374 nt8.62□□□□□ -1.03
VHS1Q03785 GTB1YDR221W 2109 nt8.62□□□□□ -1.03
VHS1Q03785 AIM1YAL046C 357 nt8.61□□□□□ -1.03
VHS1Q03785 YDR455CYDR455C 309 nt8.6□□□□□ -1.03
VHS1Q03785 TIM44YIL022W 1296 nt8.6□□□□□ -1.03
VHS1Q03785 QDR2YIL121W 1629 nt8.6□□□□□ -1.03
VHS1Q03785 THI72YOR192C 1800 nt8.59□□□□□ -1.03
VHS1Q03785 ESBP6YNL125C 2022 nt8.59□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.8 ms