Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMAD3P84022 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMAD3P84022 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMAD3P84022 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SMAD3P84022 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMAD3P84022 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMAD3P84022 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMAD3P84022 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMAD3P84022 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMAD3P84022 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SMAD3P84022 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMAD3P84022 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMAD3P84022 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMAD3P84022 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SMAD3P84022 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMAD3P84022 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMAD3P84022 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMAD3P84022 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMAD3P84022 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMAD3P84022 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMAD3P84022 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMAD3P84022 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMAD3P84022 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SMAD3P84022 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SMAD3P84022 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMAD3P84022 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SMAD3P84022 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMAD3P84022 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMAD3P84022 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SMAD3P84022 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMAD3P84022 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMAD3P84022 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SMAD3P84022 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SMAD3P84022 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SMAD3P84022 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SMAD3P84022 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMAD3P84022 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMAD3P84022 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMAD3P84022 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMAD3P84022 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMAD3P84022 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMAD3P84022 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMAD3P84022 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMAD3P84022 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMAD3P84022 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMAD3P84022 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMAD3P84022 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMAD3P84022 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SMAD3P84022 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SMAD3P84022 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SMAD3P84022 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SMAD3P84022 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SMAD3P84022 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SMAD3P84022 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SMAD3P84022 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMAD3P84022 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMAD3P84022 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMAD3P84022 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SMAD3P84022 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SMAD3P84022 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SMAD3P84022 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SMAD3P84022 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SMAD3P84022 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SMAD3P84022 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SMAD3P84022 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SMAD3P84022 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SMAD3P84022 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SMAD3P84022 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SMAD3P84022 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMAD3P84022 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMAD3P84022 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMAD3P84022 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMAD3P84022 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMAD3P84022 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMAD3P84022 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMAD3P84022 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMAD3P84022 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMAD3P84022 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMAD3P84022 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMAD3P84022 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMAD3P84022 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMAD3P84022 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMAD3P84022 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMAD3P84022 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMAD3P84022 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMAD3P84022 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMAD3P84022 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMAD3P84022 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMAD3P84022 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMAD3P84022 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMAD3P84022 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SMAD3P84022 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SMAD3P84022 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMAD3P84022 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMAD3P84022 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SMAD3P84022 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SMAD3P84022 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SMAD3P84022 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SMAD3P84022 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SMAD3P84022 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms