Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 RIB3YDR487C 627 nt9.31□□□□□ -0.92
SEC28P40509 GND1YHR183W 1470 nt9.3□□□□□ -0.92
SEC28P40509 ILV2YMR108W 2064 nt9.28□□□□□ -0.92
SEC28P40509 SEC61YLR378C 1443 nt9.28□□□□□ -0.92
SEC28P40509 FCY21YER060W 1587 nt9.28□□□□□ -0.92
SEC28P40509 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt9.27□□□□□ -0.93
SEC28P40509 DTR1YBR180W 1719 nt9.25□□□□□ -0.93
SEC28P40509 RBG2YGR173W 1107 nt9.24□□□□□ -0.93
SEC28P40509 SMM1YNR015W 1155 nt9.24□□□□□ -0.93
SEC28P40509 SPP2YOR148C 558 nt9.24□□□□□ -0.93
SEC28P40509 RSC8YFR037C 1674 nt9.23□□□□□ -0.93
SEC28P40509 NUC1YJL208C 990 nt9.23□□□□□ -0.93
SEC28P40509 LOT5YKL183W 921 nt9.23□□□□□ -0.93
SEC28P40509 RFC1YOR217W 2586 nt9.23□□□□□ -0.93
SEC28P40509 PRY1YJL079C 900 nt9.22□□□□□ -0.93
SEC28P40509 OXA1YER154W 1209 nt9.21□□□□□ -0.94
SEC28P40509 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt9.21□□□□□ -0.94
SEC28P40509 YNL024CYNL024C 741 nt9.21□□□□□ -0.94
SEC28P40509 BNI5YNL166C 1347 nt9.21□□□□□ -0.94
SEC28P40509 VPS62YGR141W 1404 nt9.21□□□□□ -0.94
SEC28P40509 MUP1YGR055W 1725 nt9.2□□□□□ -0.94
SEC28P40509 ILV3YJR016C 1758 nt9.2□□□□□ -0.94
SEC28P40509 CAB5YDR196C 726 nt9.2□□□□□ -0.94
SEC28P40509 FMS1YMR020W 1527 nt9.2□□□□□ -0.94
SEC28P40509 LSB5YCL034W 1065 nt9.19□□□□□ -0.94
SEC28P40509 DLD2YDL178W 1593 nt9.18□□□□□ -0.94
SEC28P40509 YER188WYER188W 720 nt9.18□□□□□ -0.94
SEC28P40509 FLR1YBR008C 1647 nt9.18□□□□□ -0.94
SEC28P40509 YOR325WYOR325W 474 nt9.18□□□□□ -0.94
SEC28P40509 YPS3YLR121C 1527 nt9.17□□□□□ -0.94
SEC28P40509 PHO23YNL097C 993 nt9.17□□□□□ -0.94
SEC28P40509 LSB3YFR024C-A 1380 nt9.16□□□□□ -0.94
SEC28P40509 CCT2YIL142W 1584 nt9.16□□□□□ -0.94
SEC28P40509 MSC1YML128C 1542 nt9.15□□□□□ -0.94
SEC28P40509 RAS2YNL098C 969 nt9.15□□□□□ -0.94
SEC28P40509 CSM1YCR086W 573 nt9.14□□□□□ -0.95
SEC28P40509 YDL086WYDL086W 822 nt9.14□□□□□ -0.95
SEC28P40509 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt9.14□□□□□ -0.95
SEC28P40509 OSH7YHR001W 1314 nt9.13□□□□□ -0.95
SEC28P40509 VRG4YGL225W 1014 nt9.13□□□□□ -0.95
SEC28P40509 OPI10YOL032W 741 nt9.13□□□□□ -0.95
SEC28P40509 FUB1YCR076C 753 nt9.12□□□□□ -0.95
SEC28P40509 HMG2YLR450W 3138 nt9.12□□□□□ -0.95
SEC28P40509 YPI1YFR003C 468 nt9.11□□□□□ -0.95
SEC28P40509 GTB1YDR221W 2109 nt9.1□□□□□ -0.95
SEC28P40509 RPT5YOR117W 1305 nt9.09□□□□□ -0.95
SEC28P40509 ACH1YBL015W 1581 nt9.09□□□□□ -0.95
SEC28P40509 BET2YPR176C 978 nt9.08□□□□□ -0.96
SEC28P40509 TPO4YOR273C 1980 nt9.07□□□□□ -0.96
SEC28P40509 YJL055WYJL055W 738 nt9.07□□□□□ -0.96
SEC28P40509 MAS1YLR163C 1389 nt9.07□□□□□ -0.96
SEC28P40509 HOL1YNR055C 1761 nt9.07□□□□□ -0.96
SEC28P40509 HEM14YER014W 1620 nt9.05□□□□□ -0.96
SEC28P40509 YJL118WYJL118W 660 nt9.05□□□□□ -0.96
SEC28P40509 HEM13YDR044W 987 nt9.04□□□□□ -0.96
SEC28P40509 OYE2YHR179W 1203 nt9.04□□□□□ -0.96
SEC28P40509 RIB2YOL066C 1776 nt9.04□□□□□ -0.96
SEC28P40509 MCM5YLR274W 2328 nt9.03□□□□□ -0.96
SEC28P40509 HXT12YIL170W 1374 nt9.03□□□□□ -0.96
SEC28P40509 RIB7YBR153W 735 nt9.03□□□□□ -0.96
SEC28P40509 ARO8YGL202W 1503 nt9.03□□□□□ -0.96
SEC28P40509 GAL2YLR081W 1725 nt9.02□□□□□ -0.96
SEC28P40509 COQ8YGL119W 1506 nt9.02□□□□□ -0.97
SEC28P40509 SOL2YCR073W-A 948 nt9.02□□□□□ -0.97
SEC28P40509 QDR2YIL121W 1629 nt9.02□□□□□ -0.97
SEC28P40509 DIG1YPL049C 1359 nt9.01□□□□□ -0.97
SEC28P40509 HIS2YFR025C 1008 nt9.01□□□□□ -0.97
SEC28P40509 KES1YPL145C 1305 nt9.01□□□□□ -0.97
SEC28P40509 LSM5YER146W 282 nt8.99□□□□□ -0.97
SEC28P40509 ASP3-1YLR155C 1089 nt8.99□□□□□ -0.97
SEC28P40509 ASP3-2YLR157C 1089 nt8.99□□□□□ -0.97
SEC28P40509 ASP3-3YLR158C 1089 nt8.99□□□□□ -0.97
SEC28P40509 ASP3-4YLR160C 1089 nt8.99□□□□□ -0.97
SEC28P40509 TPS1YBR126C 1488 nt8.99□□□□□ -0.97
SEC28P40509 URA8YJR103W 1737 nt8.99□□□□□ -0.97
SEC28P40509 SAM3YPL274W 1764 nt8.99□□□□□ -0.97
SEC28P40509 RIM8YGL045W 1629 nt8.98□□□□□ -0.97
SEC28P40509 GPN2YOR262W 1044 nt8.98□□□□□ -0.97
SEC28P40509 EAF3YPR023C 1206 nt8.98□□□□□ -0.97
SEC28P40509 YNR029CYNR029C 1290 nt8.97□□□□□ -0.97
SEC28P40509 ADH1YOL086C 1047 nt8.97□□□□□ -0.97
SEC28P40509 TOK1YJL093C 2076 nt8.96□□□□□ -0.97
SEC28P40509 LSB6YJL100W 1824 nt8.96□□□□□ -0.97
SEC28P40509 AIM1YAL046C 357 nt8.96□□□□□ -0.98
SEC28P40509 TAT2YOL020W 1779 nt8.94□□□□□ -0.98
SEC28P40509 SGA1YIL099W 1650 nt8.93□□□□□ -0.98
SEC28P40509 MAE1YKL029C 2010 nt8.93□□□□□ -0.98
SEC28P40509 GAL3YDR009W 1563 nt8.92□□□□□ -0.98
SEC28P40509 ENT4YLL038C 744 nt8.92□□□□□ -0.98
SEC28P40509 YLR046CYLR046C 813 nt8.92□□□□□ -0.98
SEC28P40509 DDI1YER143W 1287 nt8.91□□□□□ -0.98
SEC28P40509 YJL195CYJL195C 702 nt8.9□□□□□ -0.98
SEC28P40509 YGL114WYGL114W 2178 nt8.9□□□□□ -0.98
SEC28P40509 GID8YMR135C 1368 nt8.89□□□□□ -0.99
SEC28P40509 UGP1YKL035W 1500 nt8.87□□□□□ -0.99
SEC28P40509 TMA23YMR269W 636 nt8.87□□□□□ -0.99
SEC28P40509 YDR455CYDR455C 309 nt8.86□□□□□ -0.99
SEC28P40509 ERG13YML126C 1476 nt8.85□□□□□ -0.99
SEC28P40509 RSC4YKR008W 1878 nt8.85□□□□□ -0.99
SEC28P40509 YKL133CYKL133C 1392 nt8.84□□□□□ -0.99
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