Protein–RNA interactions for Protein: P40080

VFA1, VPS4-associated protein 1, yeastyeast

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Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1P40080 HOL1YNR055C 1761 nt10.05□□□□□ -0.8
VFA1P40080 BNI5YNL166C 1347 nt10.03□□□□□ -0.8
VFA1P40080 DLD2YDL178W 1593 nt10.02□□□□□ -0.81
VFA1P40080 ACH1YBL015W 1581 nt10.02□□□□□ -0.81
VFA1P40080 YPS3YLR121C 1527 nt10.02□□□□□ -0.81
VFA1P40080 SEC61YLR378C 1443 nt10.01□□□□□ -0.81
VFA1P40080 RIB3YDR487C 627 nt10.01□□□□□ -0.81
VFA1P40080 CCT2YIL142W 1584 nt10.01□□□□□ -0.81
VFA1P40080 APT2YDR441C 546 nt10□□□□□ -0.81
VFA1P40080 PRY1YJL079C 900 nt9.99□□□□□ -0.81
VFA1P40080 SMM1YNR015W 1155 nt9.99□□□□□ -0.81
VFA1P40080 OPI10YOL032W 741 nt9.99□□□□□ -0.81
VFA1P40080 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt9.98□□□□□ -0.81
VFA1P40080 OXA1YER154W 1209 nt9.97□□□□□ -0.81
VFA1P40080 GND1YHR183W 1470 nt9.96□□□□□ -0.82
VFA1P40080 CSM1YCR086W 573 nt9.95□□□□□ -0.82
VFA1P40080 YER188WYER188W 720 nt9.95□□□□□ -0.82
VFA1P40080 PHO23YNL097C 993 nt9.95□□□□□ -0.82
VFA1P40080 MSC1YML128C 1542 nt9.94□□□□□ -0.82
VFA1P40080 VPS62YGR141W 1404 nt9.94□□□□□ -0.82
VFA1P40080 LOT5YKL183W 921 nt9.94□□□□□ -0.82
VFA1P40080 YMR226CYMR226C 804 nt9.94□□□□□ -0.82
VFA1P40080 ARO8YGL202W 1503 nt9.93□□□□□ -0.82
VFA1P40080 FUB1YCR076C 753 nt9.93□□□□□ -0.82
VFA1P40080 HEM13YDR044W 987 nt9.93□□□□□ -0.82
VFA1P40080 BET2YPR176C 978 nt9.93□□□□□ -0.82
VFA1P40080 LSB6YJL100W 1824 nt9.92□□□□□ -0.82
VFA1P40080 RIM8YGL045W 1629 nt9.92□□□□□ -0.82
VFA1P40080 COQ8YGL119W 1506 nt9.92□□□□□ -0.82
VFA1P40080 NUC1YJL208C 990 nt9.9□□□□□ -0.82
VFA1P40080 YDL086WYDL086W 822 nt9.88□□□□□ -0.83
VFA1P40080 RBG2YGR173W 1107 nt9.88□□□□□ -0.83
VFA1P40080 KES1YPL145C 1305 nt9.87□□□□□ -0.83
VFA1P40080 OSH7YHR001W 1314 nt9.86□□□□□ -0.83
VFA1P40080 SAM3YPL274W 1764 nt9.86□□□□□ -0.83
VFA1P40080 YJL055WYJL055W 738 nt9.86□□□□□ -0.83
VFA1P40080 RAS2YNL098C 969 nt9.86□□□□□ -0.83
VFA1P40080 LSB5YCL034W 1065 nt9.86□□□□□ -0.83
VFA1P40080 LSB3YFR024C-A 1380 nt9.84□□□□□ -0.83
VFA1P40080 TAT2YOL020W 1779 nt9.83□□□□□ -0.84
VFA1P40080 QDR2YIL121W 1629 nt9.83□□□□□ -0.84
VFA1P40080 YGL114WYGL114W 2178 nt9.83□□□□□ -0.84
VFA1P40080 SGA1YIL099W 1650 nt9.82□□□□□ -0.84
VFA1P40080 UGP1YKL035W 1500 nt9.82□□□□□ -0.84
VFA1P40080 SOL2YCR073W-A 948 nt9.81□□□□□ -0.84
VFA1P40080 VRG4YGL225W 1014 nt9.81□□□□□ -0.84
VFA1P40080 YJL118WYJL118W 660 nt9.81□□□□□ -0.84
VFA1P40080 RPT5YOR117W 1305 nt9.81□□□□□ -0.84
VFA1P40080 HIS2YFR025C 1008 nt9.79□□□□□ -0.84
VFA1P40080 RIB2YOL066C 1776 nt9.78□□□□□ -0.84
VFA1P40080 HXT12YIL170W 1374 nt9.77□□□□□ -0.84
VFA1P40080 DIG1YPL049C 1359 nt9.77□□□□□ -0.84
VFA1P40080 OYE2YHR179W 1203 nt9.77□□□□□ -0.85
VFA1P40080 EAF3YPR023C 1206 nt9.77□□□□□ -0.85
VFA1P40080 TPS1YBR126C 1488 nt9.77□□□□□ -0.85
VFA1P40080 AIM1YAL046C 357 nt9.76□□□□□ -0.85
VFA1P40080 YPI1YFR003C 468 nt9.75□□□□□ -0.85
VFA1P40080 GID8YMR135C 1368 nt9.75□□□□□ -0.85
VFA1P40080 ZAP1YJL056C 2643 nt9.74□□□□□ -0.85
VFA1P40080 YDR455CYDR455C 309 nt9.74□□□□□ -0.85
VFA1P40080 LSM5YER146W 282 nt9.73□□□□□ -0.85
VFA1P40080 GPN2YOR262W 1044 nt9.73□□□□□ -0.85
VFA1P40080 ASP3-1YLR155C 1089 nt9.72□□□□□ -0.85
VFA1P40080 ASP3-2YLR157C 1089 nt9.72□□□□□ -0.85
VFA1P40080 ASP3-3YLR158C 1089 nt9.72□□□□□ -0.85
VFA1P40080 ASP3-4YLR160C 1089 nt9.72□□□□□ -0.85
VFA1P40080 HEL2YDR266C 1920 nt9.72□□□□□ -0.85
VFA1P40080 MRS6YOR370C 1812 nt9.71□□□□□ -0.85
VFA1P40080 DDI1YER143W 1287 nt9.71□□□□□ -0.86
VFA1P40080 GAL3YDR009W 1563 nt9.71□□□□□ -0.86
VFA1P40080 YNR029CYNR029C 1290 nt9.7□□□□□ -0.86
VFA1P40080 YMR209CYMR209C 1374 nt9.7□□□□□ -0.86
VFA1P40080 YKL133CYKL133C 1392 nt9.67□□□□□ -0.86
VFA1P40080 ADH1YOL086C 1047 nt9.67□□□□□ -0.86
VFA1P40080 RIB7YBR153W 735 nt9.67□□□□□ -0.86
VFA1P40080 YLR046CYLR046C 813 nt9.66□□□□□ -0.86
VFA1P40080 YHR219WYHR219W 1875 nt9.66□□□□□ -0.86
VFA1P40080 TMA23YMR269W 636 nt9.65□□□□□ -0.86
VFA1P40080 ERG13YML126C 1476 nt9.65□□□□□ -0.87
VFA1P40080 DLD3YEL071W 1491 nt9.62□□□□□ -0.87
VFA1P40080 ENT4YLL038C 744 nt9.62□□□□□ -0.87
VFA1P40080 LSR1LSR1 1175 nt9.61□□□□□ -0.87
VFA1P40080 ITR2YOL103W 1830 nt9.59□□□□□ -0.87
VFA1P40080 ODC1YPL134C 933 nt9.59□□□□□ -0.87
VFA1P40080 SSL2YIL143C 2532 nt9.58□□□□□ -0.88
VFA1P40080 SAC7YDR389W 1965 nt9.57□□□□□ -0.88
VFA1P40080 IMO32YGR031W 1029 nt9.57□□□□□ -0.88
VFA1P40080 SNZ1YMR096W 894 nt9.55□□□□□ -0.88
VFA1P40080 NME1NME1 340 nt9.54□□□□□ -0.88
VFA1P40080 RRT8YOL048C 1029 nt9.53□□□□□ -0.88
VFA1P40080 ADE8YDR408C 645 nt9.52□□□□□ -0.89
VFA1P40080 YJL195CYJL195C 702 nt9.52□□□□□ -0.89
VFA1P40080 DAK2YFL053W 1776 nt9.52□□□□□ -0.89
VFA1P40080 TIP1YBR067C 633 nt9.51□□□□□ -0.89
VFA1P40080 RPD3YNL330C 1302 nt9.51□□□□□ -0.89
VFA1P40080 DMA2YNL116W 1569 nt9.5□□□□□ -0.89
VFA1P40080 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt9.49□□□□□ -0.89
VFA1P40080 MAE1YKL029C 2010 nt9.48□□□□□ -0.89
VFA1P40080 ELO1YJL196C 933 nt9.48□□□□□ -0.89
VFA1P40080 VMA11YPL234C 495 nt9.48□□□□□ -0.89
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