Protein–RNA interactions for Protein: B8ZZF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B8ZZF3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
B8ZZF3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
B8ZZF3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
B8ZZF3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
B8ZZF3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
B8ZZF3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
B8ZZF3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
B8ZZF3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
B8ZZF3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
B8ZZF3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
B8ZZF3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
B8ZZF3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
B8ZZF3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
B8ZZF3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
B8ZZF3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
B8ZZF3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
B8ZZF3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
B8ZZF3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
B8ZZF3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
B8ZZF3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
B8ZZF3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
B8ZZF3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
B8ZZF3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
B8ZZF3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
B8ZZF3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
B8ZZF3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
B8ZZF3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
B8ZZF3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
B8ZZF3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
B8ZZF3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
B8ZZF3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
B8ZZF3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
B8ZZF3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
B8ZZF3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
B8ZZF3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
B8ZZF3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
B8ZZF3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
B8ZZF3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
B8ZZF3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
B8ZZF3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
B8ZZF3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
B8ZZF3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
B8ZZF3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
B8ZZF3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
B8ZZF3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
B8ZZF3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
B8ZZF3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
B8ZZF3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
B8ZZF3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
B8ZZF3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
B8ZZF3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
B8ZZF3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
B8ZZF3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
B8ZZF3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
B8ZZF3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
B8ZZF3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
B8ZZF3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
B8ZZF3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
B8ZZF3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
B8ZZF3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
B8ZZF3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
B8ZZF3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
B8ZZF3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
B8ZZF3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
B8ZZF3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
B8ZZF3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
B8ZZF3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
B8ZZF3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
B8ZZF3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
B8ZZF3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
B8ZZF3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
B8ZZF3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
B8ZZF3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
B8ZZF3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
B8ZZF3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
B8ZZF3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
B8ZZF3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
B8ZZF3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
B8ZZF3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
B8ZZF3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
B8ZZF3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
B8ZZF3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
B8ZZF3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
B8ZZF3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
B8ZZF3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
B8ZZF3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
B8ZZF3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
B8ZZF3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
B8ZZF3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
B8ZZF3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
B8ZZF3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
B8ZZF3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
B8ZZF3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
B8ZZF3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
B8ZZF3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
B8ZZF3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
B8ZZF3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
B8ZZF3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
B8ZZF3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
B8ZZF3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 208.1 ms