Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SCN11AQ9UI33 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCN11AQ9UI33 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms