Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASS4Q9NQ75 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms