Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX79

STRA6, Stimulated by retinoic acid gene 6 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRA6Q9BX79 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRA6Q9BX79 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
STRA6Q9BX79 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRA6Q9BX79 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRA6Q9BX79 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRA6Q9BX79 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRA6Q9BX79 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRA6Q9BX79 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRA6Q9BX79 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRA6Q9BX79 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
STRA6Q9BX79 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRA6Q9BX79 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRA6Q9BX79 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRA6Q9BX79 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRA6Q9BX79 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
STRA6Q9BX79 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
STRA6Q9BX79 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
STRA6Q9BX79 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
STRA6Q9BX79 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRA6Q9BX79 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
STRA6Q9BX79 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRA6Q9BX79 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
STRA6Q9BX79 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23■■□□□ 1.27
STRA6Q9BX79 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRA6Q9BX79 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
STRA6Q9BX79 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
STRA6Q9BX79 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
STRA6Q9BX79 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
STRA6Q9BX79 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms