Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
BHLHA9Q7RTU4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BHLHA9Q7RTU4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms