Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8Q7

PDE12, 2',5'-phosphodiesterase 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE12Q6L8Q7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE12Q6L8Q7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE12Q6L8Q7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE12Q6L8Q7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE12Q6L8Q7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE12Q6L8Q7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE12Q6L8Q7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE12Q6L8Q7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE12Q6L8Q7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE12Q6L8Q7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE12Q6L8Q7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE12Q6L8Q7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE12Q6L8Q7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE12Q6L8Q7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE12Q6L8Q7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE12Q6L8Q7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE12Q6L8Q7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE12Q6L8Q7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE12Q6L8Q7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE12Q6L8Q7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE12Q6L8Q7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE12Q6L8Q7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE12Q6L8Q7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE12Q6L8Q7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE12Q6L8Q7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE12Q6L8Q7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE12Q6L8Q7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms