Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 RSRP1-207ENST00000498238 2941 ntTSL 210.74□□□□□ -0.695e-6■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 RSRP1-216ENST00000568212 570 ntTSL 410.57□□□□□ -0.725e-6■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 CENPC-205ENST00000510189 2917 ntTSL 1 (best)9.63□□□□□ -0.875e-6■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 STAG3L5P-PVRIG2P-PILRB-204ENST00000472646 553 ntTSL 59.49□□□□□ -0.895e-6■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 SRSF4-208ENST00000634348 8128 ntTSL 59.23□□□□□ -0.935e-6■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 SRSF4-204ENST00000489898 393 ntTSL 39.09□□□□□ -0.955e-6■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 STAG3L5P-PVRIG2P-PILRB-201ENST00000310771 3634 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.965e-6■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 UFD1-206ENST00000466373 3059 ntTSL 28.83□□□□□ -15e-6■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 CENPC-203ENST00000506882 3436 ntTSL 1 (best)8.61□□□□□ -1.035e-6■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 CENPC-201ENST00000273853 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.065e-6■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 UFD1-205ENST00000459854 5038 ntTSL 1 (best)8.24□□□□□ -1.095e-6■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 SRSF4-205ENST00000497015 516 ntTSL 27.78□□□□□ -1.165e-6■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 EIF3B-208ENST00000466199 734 ntTSL 27.57□□□□□ -1.25e-6■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 CENPC-206ENST00000513216 2799 ntTSL 52.63□□□□□ -1.995e-6■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.973e-7■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 MST1-220ENST00000497359 1917 ntTSL 519.27■□□□□ 0.671e-13■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 MST1-204ENST00000479115 2285 ntTSL 518.62■□□□□ 0.571e-13■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 AHSA2-204ENST00000463681 453 ntTSL 518.55■□□□□ 0.563e-7■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 MST1-210ENST00000484673 1307 ntTSL 216.31■□□□□ 0.21e-13■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 MST1-215ENST00000492329 2006 ntTSL 515.95■□□□□ 0.141e-13■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 TAF1C-219ENST00000568265 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 415.58■□□□□ 0.083e-7■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.013e-7■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 MST1-209ENST00000484269 1518 ntTSL 514.52□□□□□ -0.081e-13■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 MST1-216ENST00000492370 1374 ntTSL 1 (best)14.35□□□□□ -0.111e-13■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.123e-7■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 TAF1C-208ENST00000563428 2531 ntTSL 213.85□□□□□ -0.193e-7■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 TAF1C-204ENST00000544090 2747 ntTSL 213.49□□□□□ -0.253e-7■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 TAF1C-217ENST00000566903 2628 ntTSL 513.12□□□□□ -0.313e-7■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.313e-7■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.373e-7■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.451e-13■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 MST1-218ENST00000494809 859 ntTSL 312.11□□□□□ -0.471e-13■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 MST1-211ENST00000488350 4152 ntTSL 511.84□□□□□ -0.511e-13■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 MST1-212ENST00000489007 737 ntTSL 311.42□□□□□ -0.581e-13■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 TAF1C-212ENST00000564774 4637 ntTSL 211.24□□□□□ -0.613e-7■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 MST1-219ENST00000494828 621 ntTSL 411.07□□□□□ -0.641e-13■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 TAF1C-207ENST00000562445 259 ntTSL 310.86□□□□□ -0.673e-7■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 TAF1C-223ENST00000570270 597 ntTSL 310.79□□□□□ -0.683e-7■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 TAF1C-201ENST00000341690 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.733e-7■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 TAF1C-218ENST00000567759 3879 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.773e-7■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 TAF1C-203ENST00000541676 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.843e-7■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 TAF1C-209ENST00000564208 3810 ntTSL 29.29□□□□□ -0.923e-7■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 RPS24-212ENST00000482069 539 ntTSL 38.61□□□□□ -1.033e-8■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 RPS24-206ENST00000465692 778 ntTSL 27.96□□□□□ -1.143e-8■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 RPS24-211ENST00000480662 711 ntTSL 27.93□□□□□ -1.143e-8■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 ASPSCR1-220ENST00000585140 447 ntTSL 314.22□□□□□ -0.132e-28■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 ASPSCR1-214ENST00000582404 534 ntTSL 313.44□□□□□ -0.262e-28■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 ASPSCR1-206ENST00000578361 590 ntTSL 211.51□□□□□ -0.572e-28■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 ASPSCR1-217ENST00000583693 3976 ntTSL 210.72□□□□□ -0.692e-28■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 ASPSCR1-215ENST00000583142 532 ntTSL 38.65□□□□□ -1.022e-28■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 PWAR5-201ENST00000624480 3180 ntBASIC7.31□□□□□ -1.248e-8■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 SNHG14-214ENST00000551361 550 ntTSL 35.54□□□□□ -1.528e-8■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 AC124312.1-202ENST00000557230 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 55.49□□□□□ -1.538e-8■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.598e-8■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC3.14□□□□□ -1.918e-8■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.068e-8■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.43□□□□□ -0.261e-7■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.04□□□□□ -2.081e-7■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC0.94□□□□□ -2.261e-7■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 ACADVL-236ENST00000583850 903 ntTSL 214.88□□□□□ -0.036e-6■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 ACADVL-232ENST00000583074 410 ntTSL 514.77□□□□□ -0.056e-6■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 ACADVL-214ENST00000578711 1732 nt13.9□□□□□ -0.186e-6■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 ACADVL-220ENST00000579546 582 ntTSL 513.75□□□□□ -0.216e-6■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 ACADVL-204ENST00000542255 1016 ntTSL 513.28□□□□□ -0.286e-6■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 ACADVL-219ENST00000579425 1234 ntTSL 511.7□□□□□ -0.546e-6■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 ACADVL-239ENST00000585203 947 ntTSL 511.7□□□□□ -0.546e-6■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 DDX5-214ENST00000580026 1171 ntTSL 28.22□□□□□ -1.096e-6■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 SLC7A2-201ENST00000004531 7560 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.166e-6■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 SLC7A2-202ENST00000398090 7557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.176e-6■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 SLC7A2-203ENST00000470360 7638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.36e-6■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 SLC7A2-204ENST00000494857 7622 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.326e-6■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 DDX5-216ENST00000581237 592 ntTSL 56.2□□□□□ -1.426e-6■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.16□□□□□ -1.96e-6■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.897e-6■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 RABL6-210ENST00000484471 2746 ntTSL 516.53■□□□□ 0.247e-6■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.017e-6■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.117e-6■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 RABL6-208ENST00000464941 3361 ntTSL 213.83□□□□□ -0.197e-6■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 ACIN1-219ENST00000556052 746 ntTSL 211.8□□□□□ -0.527e-6■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 ACIN1-216ENST00000555478 1017 ntTSL 511.07□□□□□ -0.647e-6■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 ACIN1-209ENST00000553790 756 ntTSL 29.36□□□□□ -0.917e-6■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 ACIN1-210ENST00000554680 888 ntTSL 28.56□□□□□ -1.047e-6■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 ACIN1-218ENST00000555807 928 ntTSL 28.03□□□□□ -1.127e-6■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 ACIN1-220ENST00000557039 727 ntTSL 37.74□□□□□ -1.177e-6■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 PTP4A1-207ENST00000639568 532 ntTSL 58.64□□□□□ -1.031e-7■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 PTP4A1-202ENST00000470661 479 ntTSL 26.17□□□□□ -1.421e-7■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 TAF1D-216ENST00000532235 334 ntTSL 312.77□□□□□ -0.373e-8■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 TAF1D-220ENST00000534770 737 ntTSL 312.3□□□□□ -0.443e-8■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 TAF1D-217ENST00000532455 565 ntTSL 412.18□□□□□ -0.463e-8■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 PLK1-203ENST00000562407 540 ntTSL 29.74□□□□□ -0.852e-6■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.372e-6■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 FBXO31-204ENST00000565593 2717 ntTSL 516.74■□□□□ 0.272e-6■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 ENC1-202ENST00000508331 1405 ntTSL 416.22■□□□□ 0.192e-6■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 ENC1-203ENST00000509127 584 ntTSL 316.16■□□□□ 0.182e-6■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.152e-6■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.012e-6■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.042e-6■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.062e-6■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.12e-6■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 ENC1-206ENST00000537006 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.662e-6■□□□□ 8.3
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