Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
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COL19A1Q14993 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
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COL19A1Q14993 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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COL19A1Q14993 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
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COL19A1Q14993 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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COL19A1Q14993 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
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COL19A1Q14993 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
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COL19A1Q14993 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL19A1Q14993 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
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COL19A1Q14993 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL19A1Q14993 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL19A1Q14993 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COL19A1Q14993 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL19A1Q14993 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL19A1Q14993 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COL19A1Q14993 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL19A1Q14993 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL19A1Q14993 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL19A1Q14993 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
COL19A1Q14993 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL19A1Q14993 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COL19A1Q14993 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
COL19A1Q14993 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COL19A1Q14993 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COL19A1Q14993 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COL19A1Q14993 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL19A1Q14993 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL19A1Q14993 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL19A1Q14993 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL19A1Q14993 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL19A1Q14993 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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