Protein–RNA interactions for Protein: Q13068

GAGE4, G antigen 4, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAGE4Q13068 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GAGE4Q13068 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
GAGE4Q13068 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GAGE4Q13068 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GAGE4Q13068 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GAGE4Q13068 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GAGE4Q13068 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GAGE4Q13068 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GAGE4Q13068 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GAGE4Q13068 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GAGE4Q13068 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GAGE4Q13068 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GAGE4Q13068 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
GAGE4Q13068 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GAGE4Q13068 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GAGE4Q13068 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GAGE4Q13068 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GAGE4Q13068 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GAGE4Q13068 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
GAGE4Q13068 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GAGE4Q13068 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GAGE4Q13068 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GAGE4Q13068 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GAGE4Q13068 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms