Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTP4A2Q12974 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTP4A2Q12974 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
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