Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RUNX1Q01196 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RUNX1Q01196 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms