Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERCC5P28715 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERCC5P28715 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.8 ms