Protein–RNA interactions for Protein: O94761

RECQL4, ATP-dependent DNA helicase Q4, humanhuman

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQL4O94761 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RECQL4O94761 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RECQL4O94761 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RECQL4O94761 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RECQL4O94761 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RECQL4O94761 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RECQL4O94761 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RECQL4O94761 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RECQL4O94761 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RECQL4O94761 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RECQL4O94761 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RECQL4O94761 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RECQL4O94761 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RECQL4O94761 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RECQL4O94761 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RECQL4O94761 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RECQL4O94761 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RECQL4O94761 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RECQL4O94761 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RECQL4O94761 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RECQL4O94761 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RECQL4O94761 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RECQL4O94761 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RECQL4O94761 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RECQL4O94761 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RECQL4O94761 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RECQL4O94761 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RECQL4O94761 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RECQL4O94761 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RECQL4O94761 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RECQL4O94761 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RECQL4O94761 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RECQL4O94761 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RECQL4O94761 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms