Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
BHMG1C9JSJ3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms