Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 ZEB2-237ENST00000636732 5073 ntTSL 513.41□□□□□ -0.265e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.285e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 CKB-212ENST00000555366 419 ntTSL 212.54□□□□□ -0.45e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 AK2-206ENST00000480134 811 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.415e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 AK2-212ENST00000550338 886 ntTSL 212.47□□□□□ -0.415e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 ZEB2-233ENST00000636179 8984 ntTSL 512.44□□□□□ -0.425e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 ZEB2-234ENST00000636413 8984 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.425e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 ZEB2-246ENST00000638128 8932 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.435e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 ZEB2-202ENST00000392861 1514 ntTSL 1 (best)12.27□□□□□ -0.445e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 GATAD2B-201ENST00000368655 7478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.475e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 ZEB2-239ENST00000637045 9091 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.55e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 AK2-202ENST00000373449 3586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.595e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 AK2-215ENST00000629371 3576 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.625e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 KNL1-206ENST00000528975 578 ntTSL 411.18□□□□□ -0.625e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 ZEB2-236ENST00000636471 9583 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.715e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 ZEB2-224ENST00000539609 4061 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.735e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 ZEB2-245ENST00000638087 9339 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.755e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 KNL1-208ENST00000532056 259 ntTSL 39.78□□□□□ -0.845e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 ZEB2-201ENST00000303660 3913 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.865e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 TRIM25-204ENST00000570749 614 ntTSL 29.09□□□□□ -0.955e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 ZEB2-210ENST00000440875 1809 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.985e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.035e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 GATAD2B-203ENST00000634408 1825 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.045e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 ZEB2-205ENST00000419938 1755 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.045e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 GATAD2B-205ENST00000634564 788 ntTSL 58.51□□□□□ -1.055e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 ZEB2-206ENST00000427902 2236 ntTSL 1 (best)8.3□□□□□ -1.085e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 ZEB2-232ENST00000636026 5172 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.095e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 C19orf53-203ENST00000588841 499 ntTSL 28.18□□□□□ -1.15e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 C19orf53-204ENST00000588858 666 ntTSL 37.9□□□□□ -1.145e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 ZEB2-240ENST00000637267 2677 ntTSL 57.82□□□□□ -1.165e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 ZEB2-238ENST00000636820 9115 ntTSL 57.51□□□□□ -1.215e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.215e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.365e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 AK2-205ENST00000469238 423 ntTSL 26.4□□□□□ -1.385e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.435e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 C19orf53-205ENST00000592760 357 ntTSL 35.9□□□□□ -1.465e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 C19orf53-201ENST00000221576 504 ntTSL 25.67□□□□□ -1.55e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 AK2-203ENST00000466029 223 ntTSL 34.46□□□□□ -1.75e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 ZNF292-209ENST00000524067 802 ntTSL 53.96□□□□□ -1.785e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 ZNF292-206ENST00000485016 596 ntTSL 33.82□□□□□ -1.85e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 PLCXD1-210ENST00000448477 828 ntTSL 213.16□□□□□ -0.31e-11■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 PLCXD1-207ENST00000443019 284 ntTSL 513.1□□□□□ -0.311e-11■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 UBE2V1-207ENST00000420027 1956 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.283e-9■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 BCAT1-201ENST00000261192 9674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.553e-9■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 BCAT1-202ENST00000342945 4319 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.023e-9■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 BCAT1-206ENST00000539780 1360 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.133e-9■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 CSDE1-206ENST00000483030 873 ntTSL 26.81□□□□□ -1.323e-9■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 BCAT1-203ENST00000355164 521 ntTSL 26.03□□□□□ -1.443e-9■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 CELF1-206ENST00000422993 553 ntTSL 55.06□□□□□ -1.63e-9■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 BCAT1-209ENST00000546285 549 ntTSL 44.97□□□□□ -1.613e-9■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 FXR1-204ENST00000461044 601 ntTSL 42.85□□□□□ -1.953e-9■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 TTLL3-210ENST00000427220 3233 ntTSL 1 (best)20.74■□□□□ 0.914e-6■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.734e-6■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 TTLL3-211ENST00000430390 1674 ntTSL 1 (best)12.08□□□□□ -0.484e-6■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 TTLL3-232ENST00000496526 5282 ntTSL 211.53□□□□□ -0.564e-6■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 TTLL3-201ENST00000310252 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)11.41□□□□□ -0.584e-6■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 TTLL3-214ENST00000431204 1041 ntTSL 511.12□□□□□ -0.634e-6■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 TTLL3-231ENST00000496246 507 ntTSL 410.71□□□□□ -0.694e-6■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 TTLL3-228ENST00000483051 4176 ntTSL 58.93□□□□□ -0.984e-6■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 TTLL3-226ENST00000474948 603 ntTSL 48.56□□□□□ -1.044e-6■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 TTLL3-220ENST00000452823 579 ntTSL 37.37□□□□□ -1.234e-6■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 FOXA1-202ENST00000545425 1806 ntTSL 224.14■■□□□ 1.462e-7■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 HMGCR-206ENST00000508070 450 ntTSL 37.26□□□□□ -1.252e-7■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 RBM39-238ENST00000493853 567 ntTSL 47.03□□□□□ -1.287e-36■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 MRPL52-209ENST00000553965 327 ntTSL 23.86□□□□□ -1.792e-7■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.671e-6■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 PSME2-211ENST00000559613 300 ntTSL 32.57□□□□□ -21e-6■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 FERMT3-208ENST00000545896 911 ntTSL 517.3■□□□□ 0.364e-15■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 DBF4-207ENST00000498144 576 ntTSL 24.57□□□□□ -1.686e-11■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 DBF4-208ENST00000498726 552 ntTSL 43.38□□□□□ -1.876e-11■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.052e-12■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 DPP7-202ENST00000460830 639 ntTSL 219.45■□□□□ 0.72e-12■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 RBM12-204ENST00000424458 1068 ntTSL 224.27■■□□□ 1.483e-17■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 CPNE1-223ENST00000475146 627 ntTSL 322.89■■□□□ 1.253e-17■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 SH3YL1-216ENST00000471948 2119 ntTSL 222.76■■□□□ 1.231e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.21e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.161e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.891e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 SH3YL1-213ENST00000463865 1999 ntTSL 519.86■□□□□ 0.771e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.671e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 CHDH-202ENST00000467802 565 ntTSL 218.72■□□□□ 0.591e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 WDR45-222ENST00000476728 569 ntTSL 418.1■□□□□ 0.491e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 WDR45-233ENST00000634736 757 ntTSL 518.1■□□□□ 0.491e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 ZFP36-202ENST00000594442 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.66■□□□□ 0.421e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.41e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 WDR45-226ENST00000496803 986 ntTSL 217.44■□□□□ 0.381e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 WDR45-232ENST00000634711 1159 ntTSL 217.44■□□□□ 0.381e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 PAPD7-205ENST00000514697 1901 ntTSL 1 (best)17.33■□□□□ 0.361e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.351e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 PUF60-214ENST00000529693 684 ntTSL 217.13■□□□□ 0.331e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 WDR45-243ENST00000635666 947 ntTSL 516.8■□□□□ 0.281e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.241e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 PLXNB2-211ENST00000492578 644 ntTSL 416.52■□□□□ 0.241e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 WDR45-231ENST00000634671 822 ntTSL 316.37■□□□□ 0.211e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.211e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.213e-17■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 CES3-207ENST00000568118 534 ntTSL 416.14■□□□□ 0.171e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 SEC11C-207ENST00000592774 1189 ntTSL 1 (best)15.85■□□□□ 0.131e-5■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 PPIG-203ENST00000414307 1062 ntTSL 1 (best)15.65■□□□□ 0.16e-8■□□□□ 8.3
EFTUD2Q15029 SH3YL1-224ENST00000488044 672 ntTSL 415.46■□□□□ 0.071e-5■□□□□ 8.3
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