RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492578.1

PLXNB2-211, Transcript of plexin B2, humanhuman

TSL 4

Gene PLXNB2, Length 644 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB2-211ENST00000492578 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.68■■■■■ 4.58
PLXNB2-211ENST00000492578 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39■■■■□ 3.83
PLXNB2-211ENST00000492578 ABCC9O60706 1549 aa38.53■■■■□ 3.76
PLXNB2-211ENST00000492578 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.85■■■■□ 3.49
PLXNB2-211ENST00000492578 NACADO15069 1562 aa36.74■■■■□ 3.47
PLXNB2-211ENST00000492578 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.44■■■■□ 3.42
PLXNB2-211ENST00000492578 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.42■■■■□ 3.42
PLXNB2-211ENST00000492578 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.33■■■■□ 3.41
PLXNB2-211ENST00000492578 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.13■■■■□ 3.38
PLXNB2-211ENST00000492578 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.11■■■■□ 3.37
PLXNB2-211ENST00000492578 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.91■■■■□ 3.34
PLXNB2-211ENST00000492578 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.91■■■■□ 3.34
PLXNB2-211ENST00000492578 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.85■■■■□ 3.33
PLXNB2-211ENST00000492578 SCRIBQ14160 1630 aa35.53■■■■□ 3.28
PLXNB2-211ENST00000492578 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.39■■■■□ 3.26
PLXNB2-211ENST00000492578 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.91■■■■□ 3.18
PLXNB2-211ENST00000492578 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.86■■■■□ 3.17
PLXNB2-211ENST00000492578 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.65■■■■□ 3.14
PLXNB2-211ENST00000492578 SMARCA4P51532 1647 aa33.98■■■■□ 3.03
PLXNB2-211ENST00000492578 NCAPD3P42695 1498 aa33.95■■■■□ 3.03
PLXNB2-211ENST00000492578 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.9■■■■□ 3.02
PLXNB2-211ENST00000492578 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.83■■■■□ 3.01
PLXNB2-211ENST00000492578 SMARCA2P51531 1590 aa33.78■■■■□ 3
PLXNB2-211ENST00000492578 HMGXB3Q12766 1538 aa33.74■■■□□ 2.99
PLXNB2-211ENST00000492578 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.7■■■□□ 2.99
PLXNB2-211ENST00000492578 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.68■■■□□ 2.98
PLXNB2-211ENST00000492578 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.53■■■□□ 2.96
PLXNB2-211ENST00000492578 NESP48681 1621 aa33.28■■■□□ 2.92
PLXNB2-211ENST00000492578 WIZO95785 1651 aa33.27■■■□□ 2.92
PLXNB2-211ENST00000492578 ERCC6Q03468 1493 aa33.14■■■□□ 2.9
PLXNB2-211ENST00000492578 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.13■■■□□ 2.89
PLXNB2-211ENST00000492578 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.08■■■□□ 2.89
PLXNB2-211ENST00000492578 CUX2O14529 1486 aa33.03■■■□□ 2.88
PLXNB2-211ENST00000492578 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.89■■■□□ 2.86
PLXNB2-211ENST00000492578 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.89■■■□□ 2.86
PLXNB2-211ENST00000492578 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.88■■■□□ 2.85
PLXNB2-211ENST00000492578 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.85■■■□□ 2.85
PLXNB2-211ENST00000492578 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.8■■■□□ 2.84
PLXNB2-211ENST00000492578 CFTRP13569 1480 aa32.66■■■□□ 2.82
PLXNB2-211ENST00000492578 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.55■■■□□ 2.8
PLXNB2-211ENST00000492578 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.52■■■□□ 2.8
PLXNB2-211ENST00000492578 WDR62O43379 1518 aa32.51■■■□□ 2.8
PLXNB2-211ENST00000492578 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.51■■■□□ 2.79
PLXNB2-211ENST00000492578 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.49■■■□□ 2.79
PLXNB2-211ENST00000492578 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.49■■■□□ 2.79
PLXNB2-211ENST00000492578 PRDM2Q13029 1718 aa32.32■■■□□ 2.76
PLXNB2-211ENST00000492578 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.29■■■□□ 2.76
PLXNB2-211ENST00000492578 TOPBP1Q92547 1522 aa31.98■■■□□ 2.71
PLXNB2-211ENST00000492578 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.89■■■□□ 2.7
PLXNB2-211ENST00000492578 ABCC8Q09428 1581 aa31.85■■■□□ 2.69
PLXNB2-211ENST00000492578 IFT140Q96RY7 1462 aa31.84■■■□□ 2.69
PLXNB2-211ENST00000492578 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.8■■■□□ 2.68
PLXNB2-211ENST00000492578 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.8■■■□□ 2.68
PLXNB2-211ENST00000492578 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.71■■■□□ 2.67
PLXNB2-211ENST00000492578 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.69■■■□□ 2.66
PLXNB2-211ENST00000492578 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.64■■■□□ 2.65
PLXNB2-211ENST00000492578 CUX1P39880 1505 aa31.62■■■□□ 2.65
PLXNB2-211ENST00000492578 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.55■■■□□ 2.64
PLXNB2-211ENST00000492578 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.53■■■□□ 2.64
PLXNB2-211ENST00000492578 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.52■■■□□ 2.643e-7■■■■□ 23.9
PLXNB2-211ENST00000492578 OSCARQ8IYS5 282 aa31.5■■■□□ 2.63
PLXNB2-211ENST00000492578 SOGA1O94964 1423 aa31.48■■■□□ 2.63
PLXNB2-211ENST00000492578 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.38■■■□□ 2.61
PLXNB2-211ENST00000492578 WDR97A6NE52 1622 aa31.35■■■□□ 2.61
PLXNB2-211ENST00000492578 CHD1O14646 1710 aa31.29■■■□□ 2.6
PLXNB2-211ENST00000492578 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.22■■■□□ 2.59
PLXNB2-211ENST00000492578 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.22■■■□□ 2.59
PLXNB2-211ENST00000492578 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.21■■■□□ 2.59
PLXNB2-211ENST00000492578 SYNJ1O43426 1573 aa31.21■■■□□ 2.59
PLXNB2-211ENST00000492578 TOP2BQ02880 1626 aa31.2■■■□□ 2.59
PLXNB2-211ENST00000492578 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.18■■■□□ 2.58
PLXNB2-211ENST00000492578 GRIN2BQ13224 1484 aa31.18■■■□□ 2.58
PLXNB2-211ENST00000492578 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.16■■■□□ 2.58
PLXNB2-211ENST00000492578 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.16■■■□□ 2.58
PLXNB2-211ENST00000492578 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.16■■■□□ 2.58
PLXNB2-211ENST00000492578 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.16■■■□□ 2.58
PLXNB2-211ENST00000492578 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.58
PLXNB2-211ENST00000492578 TRIM41Q8WV44 630 aa31.14■■■□□ 2.58
PLXNB2-211ENST00000492578 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.13■■■□□ 2.57
PLXNB2-211ENST00000492578 ARHGEF11O15085 1522 aa31.12■■■□□ 2.57
PLXNB2-211ENST00000492578 PBRM1Q86U86 1689 aa31.1■■■□□ 2.57
PLXNB2-211ENST00000492578 FBLN2P98095 1184 aa31.06■■■□□ 2.56
PLXNB2-211ENST00000492578 SYNJ2O15056 1496 aa31.03■■■□□ 2.56
PLXNB2-211ENST00000492578 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.01■■■□□ 2.55
PLXNB2-211ENST00000492578 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
PLXNB2-211ENST00000492578 ADAMTS12P58397 1594 aa30.88■■■□□ 2.53
PLXNB2-211ENST00000492578 ARAP1Q96P48 1450 aa30.87■■■□□ 2.53
PLXNB2-211ENST00000492578 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.81■■■□□ 2.52
PLXNB2-211ENST00000492578 GRIN2AQ12879 1464 aa30.81■■■□□ 2.52
PLXNB2-211ENST00000492578 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.75■■■□□ 2.51
PLXNB2-211ENST00000492578 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.74■■■□□ 2.51
PLXNB2-211ENST00000492578 NUP160Q12769 1436 aa30.73■■■□□ 2.51
PLXNB2-211ENST00000492578 CEP170Q5SW79 1584 aa30.72■■■□□ 2.51
PLXNB2-211ENST00000492578 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.57■■■□□ 2.48
PLXNB2-211ENST00000492578 SHROOM2Q13796 1616 aa30.56■■■□□ 2.48
PLXNB2-211ENST00000492578 IGF1RP08069 1367 aa30.53■■■□□ 2.48
PLXNB2-211ENST00000492578 KIF27Q86VH2 1401 aa30.52■■■□□ 2.48
PLXNB2-211ENST00000492578 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.44■■■□□ 2.46
PLXNB2-211ENST00000492578 CUL7Q14999 1698 aa30.42■■■□□ 2.46
PLXNB2-211ENST00000492578 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.31■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.7 ms