Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ3

NLGN4Y, Neuroligin-4, Y-linked, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4YQ8NFZ3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NLGN4YQ8NFZ3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms