Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
GRIN2AQ12879 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
GRIN2AQ12879 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
GRIN2AQ12879 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.1
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