Protein–RNA interactions for Protein: Q07807

PUF3, mRNA-binding protein PUF3, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF3Q07807 YPL035CYPL035C 348 nt4.74□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 MGR2YPL098C 342 nt4.74□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 NUP2YLR335W 2163 nt4.74□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 RTC1YOL138C 4026 nt4.73□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 YDR413CYDR413C 576 nt4.73□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 YER067C-AYER067C-A 324 nt4.73□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 YER107W-AYER107W-A 321 nt4.73□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 PDX1YGR193C 1233 nt4.73□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 DAD2YKR083C 402 nt4.73□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 YML031C-AYML031C-A 336 nt4.73□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 TRE1YPL176C 2352 nt4.73□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 ZPR1YGR211W 1461 nt4.73□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 YGR107WYGR107W 450 nt4.72□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 Q0143Q0143 153 nt4.72□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 OAR1YKL055C 837 nt4.72□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 ATG10YLL042C 504 nt4.72□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 CDC42YLR229C 576 nt4.72□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 YMR105W-AYMR105W-A 195 nt4.72□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 RPL18BYNL301C 561 nt4.72□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 VPS69YPR087W 321 nt4.72□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 HPA2YPR193C 471 nt4.72□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 SUS1YBR111W-A 291 nt4.72□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 YBR209WYBR209W 318 nt4.72□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 PMT4YJR143C 2289 nt4.72□□□□□ -1.65
PUF3Q07807 CTT1YGR088W 1689 nt4.71□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 PKP2YGL059W 1476 nt4.71□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 SWT1YOR166C 1377 nt4.71□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 YGR035CYGR035C 351 nt4.71□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt4.71□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt4.71□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt4.71□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 YKL044WYKL044W 321 nt4.71□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 COX8YLR395C 237 nt4.71□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 UNG1YML021C 1080 nt4.71□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 YOR379CYOR379C 339 nt4.71□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt4.71□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 ARC40YBR234C 1155 nt4.71□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 ALG11YNL048W 1647 nt4.71□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 TYW1YPL207W 2433 nt4.71□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 CDC5YMR001C 2118 nt4.7□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 PAM1YDR251W 2493 nt4.7□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 SRD1YCR018C 666 nt4.7□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 HNT1YDL125C 477 nt4.7□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 snR7-SsnR7-S 179 nt4.7□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 GRX2YDR513W 432 nt4.7□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 SAE2YGL175C 1038 nt4.7□□□□□ -1.66 RIP-Chip
PUF3Q07807 YGL193CYGL193C 312 nt4.7□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 LSO1YJR005C-A 282 nt4.7□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 ECM15YBL001C 315 nt4.7□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt4.7□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 YOL134CYOL134C 390 nt4.7□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 CIN5YOR028C 888 nt4.7□□□□□ -1.66 RIP-Chip
PUF3Q07807 YPR174CYPR174C 666 nt4.7□□□□□ -1.66 RIP-Chip
PUF3Q07807 HUL4YJR036C 2679 nt4.7□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 STE24YJR117W 1362 nt4.69□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 GAD1YMR250W 1758 nt4.69□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 EXO5YBR163W 1758 nt4.69□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 SUL2YLR092W 2682 nt4.69□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 YCR007CYCR007C 720 nt4.69□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 YPD1YDL235C 504 nt4.69□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 ATP8Q0080 147 nt4.69□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 YGL108CYGL108C 423 nt4.69□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 YJR012CYJR012C 624 nt4.69□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 YRA2YKL214C 612 nt4.69□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 ECM4YKR076W 1113 nt4.69□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 YBR016WYBR016W 387 nt4.69□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 NNK1YKL171W 2787 nt4.69□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 HSP82YPL240C 2130 nt4.69□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 SWC3YAL011W 1878 nt4.69□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 SOF1YLL011W 1470 nt4.69□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 TFB3YDR460W 966 nt4.68□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 RPB3YIL021W 957 nt4.68□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 YIR020CYIR020C 303 nt4.68□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 RPL17BYJL177W 555 nt4.68□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 ARG80YMR042W 534 nt4.68□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 MED11YMR112C 396 nt4.68□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 YOL160WYOL160W 342 nt4.68□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt4.68□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 MAK5YBR142W 2322 nt4.68□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 OSH6YKR003W 1347 nt4.68□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 VHR1YIL056W 1923 nt4.68□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 SKM1YOL113W 1968 nt4.67□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 UBP6YFR010W 1500 nt4.67□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 TDA11YHR159W 1515 nt4.67□□□□□ -1.66 RIP-Chip
PUF3Q07807 CDC55YGL190C 1581 nt4.67□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 TDA2YER071C 381 nt4.67□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 OTU2YHL013C 924 nt4.67□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 CRG1YHR209W 876 nt4.67□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 YNL150WYNL150W 408 nt4.67□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 AAR2YBL074C 1068 nt4.67□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 DER1YBR201W 636 nt4.67□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 SBE2YDR351W 2595 nt4.67□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 NTH1YDR001C 2256 nt4.67□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 ASI3YNL008C 2031 nt4.67□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 STB2YMR053C 2553 nt4.66□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 PAH1YMR165C 2589 nt4.66□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 VPS33YLR396C 2076 nt4.66□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 HAA1YPR008W 2085 nt4.66□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 ANR2YKL047W 1551 nt4.66□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 GDE1YPL110C 3672 nt4.66□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 35.1 ms