Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GTF2E1P29083 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF2E1P29083 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.2 ms