Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEFLP07196 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEFLP07196 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEFLP07196 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEFLP07196 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NEFLP07196 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEFLP07196 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEFLP07196 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEFLP07196 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEFLP07196 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEFLP07196 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEFLP07196 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEFLP07196 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEFLP07196 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEFLP07196 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEFLP07196 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEFLP07196 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEFLP07196 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEFLP07196 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEFLP07196 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEFLP07196 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEFLP07196 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NEFLP07196 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEFLP07196 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEFLP07196 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEFLP07196 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEFLP07196 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEFLP07196 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEFLP07196 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEFLP07196 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEFLP07196 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEFLP07196 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEFLP07196 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEFLP07196 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEFLP07196 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEFLP07196 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEFLP07196 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEFLP07196 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEFLP07196 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEFLP07196 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEFLP07196 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEFLP07196 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEFLP07196 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEFLP07196 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEFLP07196 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEFLP07196 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEFLP07196 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEFLP07196 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEFLP07196 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEFLP07196 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEFLP07196 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEFLP07196 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEFLP07196 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEFLP07196 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEFLP07196 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEFLP07196 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEFLP07196 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEFLP07196 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEFLP07196 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEFLP07196 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEFLP07196 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEFLP07196 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEFLP07196 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEFLP07196 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEFLP07196 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEFLP07196 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEFLP07196 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEFLP07196 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEFLP07196 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEFLP07196 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEFLP07196 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEFLP07196 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEFLP07196 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEFLP07196 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEFLP07196 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEFLP07196 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEFLP07196 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEFLP07196 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEFLP07196 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEFLP07196 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEFLP07196 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NEFLP07196 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEFLP07196 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEFLP07196 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEFLP07196 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEFLP07196 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEFLP07196 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEFLP07196 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEFLP07196 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEFLP07196 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEFLP07196 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEFLP07196 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEFLP07196 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEFLP07196 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEFLP07196 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEFLP07196 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEFLP07196 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NEFLP07196 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEFLP07196 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEFLP07196 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms