Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN7O94888 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN7O94888 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN7O94888 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN7O94888 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBXN7O94888 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN7O94888 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN7O94888 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN7O94888 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN7O94888 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN7O94888 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN7O94888 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN7O94888 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN7O94888 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN7O94888 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN7O94888 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN7O94888 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN7O94888 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN7O94888 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN7O94888 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN7O94888 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN7O94888 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN7O94888 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
UBXN7O94888 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN7O94888 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN7O94888 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN7O94888 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN7O94888 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN7O94888 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN7O94888 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN7O94888 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN7O94888 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN7O94888 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN7O94888 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN7O94888 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN7O94888 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN7O94888 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN7O94888 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN7O94888 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBXN7O94888 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBXN7O94888 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms