Protein–RNA interactions for Protein: O94761

RECQL4, ATP-dependent DNA helicase Q4, humanhuman

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQL4O94761 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RECQL4O94761 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms