Protein–RNA interactions for Protein: O00409

FOXN3, Forkhead box protein N3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3O00409 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXN3O00409 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXN3O00409 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXN3O00409 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXN3O00409 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXN3O00409 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXN3O00409 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXN3O00409 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXN3O00409 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXN3O00409 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXN3O00409 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXN3O00409 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXN3O00409 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXN3O00409 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXN3O00409 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXN3O00409 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXN3O00409 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXN3O00409 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXN3O00409 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXN3O00409 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXN3O00409 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXN3O00409 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXN3O00409 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXN3O00409 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXN3O00409 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXN3O00409 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXN3O00409 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXN3O00409 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXN3O00409 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXN3O00409 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXN3O00409 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXN3O00409 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXN3O00409 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXN3O00409 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXN3O00409 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXN3O00409 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXN3O00409 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXN3O00409 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXN3O00409 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms