Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KLF12Q9Y4X4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms