Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CGGBP1Q9UFW8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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