Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SYNE4Q8N205 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYNE4Q8N205 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms