Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
LRRC9Q6ZRR7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC32.73■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC32.7■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
LRRC9Q6ZRR7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
LRRC9Q6ZRR7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms