Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
PTPRKQ15262 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC32■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC32■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPRKQ15262 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
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