Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 SPH1YLR313C 1593 nt3.61□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 UBC13YDR092W 462 nt3.61□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 DPP1YDR284C 870 nt3.61□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 BI2Q0110 1272 nt3.61□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 MIG2YGL209W 1149 nt3.61□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 IES3YLR052W 753 nt3.61□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt3.61□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 GLO1YML004C 981 nt3.61□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 SIL1YOL031C 1266 nt3.61□□□□□ -1.83 RIP-Chip
PUF2Q12221 SCD6YPR129W 1050 nt3.61□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 CTP1YBR291C 900 nt3.61□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 MON1YGL124C 1935 nt3.61□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 YPL109CYPL109C 1974 nt3.61□□□□□ -1.83 RIP-Chip
PUF2Q12221 KRE5YOR336W 4098 nt3.61□□□□□ -1.83 RIP-Chip
PUF2Q12221 LRG1YDL240W 3054 nt3.61□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 APL4YPR029C 2499 nt3.61□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 MTL1YGR023W 1656 nt3.6□□□□□ -1.83 RIP-Chip
PUF2Q12221 RPS18AYDR450W 441 nt3.6□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 APA2YDR530C 978 nt3.6□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 FMP10YER182W 735 nt3.6□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 YGL159WYGL159W 1113 nt3.6□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 TAN1YGL232W 870 nt3.6□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 YIL161WYIL161W 708 nt3.6□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 IRC9YJL142C 393 nt3.6□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 GTT2YLL060C 702 nt3.6□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 ARG80YMR042W 534 nt3.6□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 YNL203CYNL203C 612 nt3.6□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 RFC3YNL290W 1023 nt3.6□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 YOR082CYOR082C 342 nt3.6□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 RCN2YOR220W 798 nt3.6□□□□□ -1.83 RIP-Chip
PUF2Q12221 YPR148CYPR148C 1308 nt3.6□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 BUD27YFL023W 2391 nt3.6□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 PGS1YCL004W 1566 nt3.59□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 ENP2YGR145W 2124 nt3.59□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 EPO1YMR124W 2832 nt3.59□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 DIG2YDR480W 972 nt3.59□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 SEC53YFL045C 765 nt3.59□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 YGR190CYGR190C 366 nt3.59□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 YGR290WYGR290W 444 nt3.59□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 ECI1YLR284C 843 nt3.59□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 YLR290CYLR290C 834 nt3.59□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 SPC29YPL124W 762 nt3.59□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt3.59□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt3.59□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 YLR446WYLR446W 1302 nt3.59□□□□□ -1.83 RIP-Chip
PUF2Q12221 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt3.59□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 YCL020WYCL020W 1317 nt3.59□□□□□ -1.83
PUF2Q12221 AEP2YMR282C 1743 nt3.58□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 RAD2YGR258C 3096 nt3.58□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 EMC1YCL045C 2283 nt3.58□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 snR84snR84 550 nt3.58□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 MXR1YER042W 555 nt3.58□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 YGL074CYGL074C 327 nt3.58□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 VMA5YKL080W 1179 nt3.58□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 RPL22AYLR061W 366 nt3.58□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 YMR144WYMR144W 1029 nt3.58□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 ECM13YBL043W 774 nt3.58□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 MCA1YOR197W 1299 nt3.58□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 RXT2YBR095C 1293 nt3.58□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 RPO21YDL140C 5202 nt3.58□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 MFB1YDR219C 1398 nt3.58□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 HCA4YJL033W 2313 nt3.58□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 OAF3YKR064W 2592 nt3.57□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 FKH2YNL068C 2589 nt3.57□□□□□ -1.84 RIP-Chip
PUF2Q12221 ACK1YDL203C 1872 nt3.57□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 YDR491CYDR491C 492 nt3.57□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 TMA20YER007C-A 546 nt3.57□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 RAD4YER162C 2265 nt3.57□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 NSA1YGL111W 1392 nt3.57□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 YGR042WYGR042W 816 nt3.57□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 MPC3YGR243W 441 nt3.57□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 MNL1YHR204W 2391 nt3.57□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 AVT7YIL088C 1473 nt3.57□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 YJL007CYJL007C 315 nt3.57□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 GYP6YJL044C 1377 nt3.57□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 YMR310CYMR310C 954 nt3.57□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 MIC27YNL100W 705 nt3.57□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 CIT1YNR001C 1440 nt3.57□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 CSI2YOL007C 1026 nt3.57□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 YPL205CYPL205C 345 nt3.57□□□□□ -1.84 RIP-Chip
PUF2Q12221 NIP7YPL211W 546 nt3.57□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 YPR012WYPR012W 255 nt3.57□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 SSM4YIL030C 3960 nt3.57□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 SNT1YCR033W 3681 nt3.57□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 FUN12YAL035W 3009 nt3.57□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 VID27YNL212W 2349 nt3.56□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 ELM1YKL048C 1923 nt3.56□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 TAF6YGL112C 1551 nt3.56□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 CHK1YBR274W 1584 nt3.56□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 VMA21YGR105W 234 nt3.56□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 RPF1YHR088W 888 nt3.56□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 YIL024CYIL024C 570 nt3.56□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt3.56□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 YJL175WYJL175W 513 nt3.56□□□□□ -1.84 RIP-Chip
PUF2Q12221 MAK16YAL025C 921 nt3.56□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 YKR011CYKR011C 1062 nt3.56□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 YLR050CYLR050C 486 nt3.56□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 SAS2YMR127C 1017 nt3.56□□□□□ -1.84
PUF2Q12221 RIM11YMR139W 1113 nt3.56□□□□□ -1.84 RIP-Chip
PUF2Q12221 YOR387CYOR387C 621 nt3.56□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 42.3 ms