RNAct
Search
Pairwise
Browse
Proteins
RNAs
Download
About
Search
Protein–RNA interactions for Protein: Q03691
ROT1, Protein ROT1, yeast
Predictions only
Length
256 aa
.
Download Table
Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
ROT1
Q03691
RNH203
YLR154C
333 nt
4.29
□□□□□ -1.72
ROT1
Q03691
YML108W
YML108W
318 nt
4.29
□□□□□ -1.72
ROT1
Q03691
RPL13B
YMR142C
600 nt
4.29
□□□□□ -1.72
ROT1
Q03691
PIN3
YPR154W
648 nt
4.29
□□□□□ -1.72
ROT1
Q03691
PDR15
YDR406W
4590 nt
4.29
□□□□□ -1.72
ROT1
Q03691
KRE6
YPR159W
2163 nt
4.29
□□□□□ -1.72
ROT1
Q03691
EXO1
YOR033C
2109 nt
4.28
□□□□□ -1.72
ROT1
Q03691
AXL2
YIL140W
2472 nt
4.28
□□□□□ -1.72
ROT1
Q03691
YDL071C
YDL071C
375 nt
4.28
□□□□□ -1.72
ROT1
Q03691
YGR121W-A
YGR121W-A
216 nt
4.28
□□□□□ -1.72
ROT1
Q03691
YHR182C-A
YHR182C-A
474 nt
4.28
□□□□□ -1.72
ROT1
Q03691
YIR020C
YIR020C
303 nt
4.28
□□□□□ -1.72
ROT1
Q03691
YLL044W
YLL044W
447 nt
4.28
□□□□□ -1.72
ROT1
Q03691
CSR1
YLR380W
1227 nt
4.28
□□□□□ -1.72
ROT1
Q03691
CGI121
YML036W
546 nt
4.28
□□□□□ -1.72
ROT1
Q03691
RPL15B
YMR121C
615 nt
4.28
□□□□□ -1.72
ROT1
Q03691
YPL225W
YPL225W
441 nt
4.28
□□□□□ -1.72
ROT1
Q03691
MSC2
YDR205W
2175 nt
4.28
□□□□□ -1.72
ROT1
Q03691
ADY4
YLR227C
1482 nt
4.28
□□□□□ -1.72
ROT1
Q03691
DBF4
YDR052C
2115 nt
4.28
□□□□□ -1.72
ROT1
Q03691
YDR149C
YDR149C
708 nt
4.27
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
BSC2
YDR275W
708 nt
4.27
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
SMB1
YER029C
591 nt
4.27
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
GRX4
YER174C
735 nt
4.27
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
YJL169W
YJL169W
369 nt
4.27
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
YJR085C
YJR085C
318 nt
4.27
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
ABM1
YJR108W
372 nt
4.27
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
DAD2
YKR083C
402 nt
4.27
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
AFB1
YLR040C
675 nt
4.27
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
PAI3
YMR174C
207 nt
4.27
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
ROX1
YPR065W
1107 nt
4.27
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
DER1
YBR201W
636 nt
4.27
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
FUS2
YMR232W
2034 nt
4.27
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
MSL5
YLR116W
1431 nt
4.27
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
PAN1
YIR006C
4443 nt
4.27
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
MET12
YPL023C
1974 nt
4.27
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
IMA1
YGR287C
1770 nt
4.27
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
AEP1
YMR064W
1557 nt
4.27
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
RPN6
YDL097C
1305 nt
4.26
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
LYP1
YNL268W
1836 nt
4.26
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
MRM2
YGL136C
963 nt
4.26
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
YGR017W
YGR017W
894 nt
4.26
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
SOL4
YGR248W
768 nt
4.26
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
LSO1
YJR005C-A
282 nt
4.26
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
SPC1
YJR010C-A
285 nt
4.26
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
PBA1
YLR199C
831 nt
4.26
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
BSC3
YLR465C
309 nt
4.26
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
YMR031W-A
YMR031W-A
327 nt
4.26
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
PPG1
YNR032W
1107 nt
4.26
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
YOR379C
YOR379C
339 nt
4.26
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
YCL022C
YCL022C
516 nt
4.26
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
FYV5
YCL058C
459 nt
4.26
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
YHR182W
YHR182W
2358 nt
4.26
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
ALE1
YOR175C
1860 nt
4.26
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
PAM1
YDR251W
2493 nt
4.26
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
CTM1
YHR109W
1758 nt
4.25
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
UBA2
YDR390C
1911 nt
4.25
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
OCA5
YHL029C
2040 nt
4.25
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
GOS1
YHL031C
672 nt
4.25
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
DPH1
YIL103W
1278 nt
4.25
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
YKL118W
YKL118W
312 nt
4.25
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
DCS2
YOR173W
1062 nt
4.25
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
AIM4
YBR194W
372 nt
4.25
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
TPS3
YMR261C
3165 nt
4.25
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
YPS7
YDR349C
1791 nt
4.25
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
YRB30
YGL164C
1323 nt
4.24
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
SEC27
YGL137W
2670 nt
4.24
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
snR8
snR8
190 nt
4.24
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
BNA6
YFR047C
888 nt
4.24
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
PEX4
YGR133W
552 nt
4.24
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
PXR1
YGR280C
816 nt
4.24
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
YHR193C-A
YHR193C-A
375 nt
4.24
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
NNF1
YJR112W
606 nt
4.24
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
PIR1
YKL164C
1026 nt
4.24
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
HTA2
YBL003C
399 nt
4.24
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
HAA1
YPR008W
2085 nt
4.24
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
TPD3
YAL016W
1908 nt
4.23
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
YCR018C-A
YCR018C-A
255 nt
4.23
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
HNT2
YDR305C
654 nt
4.23
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
API2
YDR525W
330 nt
4.23
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
NTF2
YER009W
378 nt
4.23
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
GSY1
YFR015C
2127 nt
4.23
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
YAL047W-A
YAL047W-A
330 nt
4.23
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
PDP3
YLR455W
915 nt
4.23
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
ARG80
YMR042W
534 nt
4.23
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
YMR087W
YMR087W
855 nt
4.23
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
YOR203W
YOR203W
354 nt
4.23
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
YPR174C
YPR174C
666 nt
4.23
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
FOX2
YKR009C
2703 nt
4.23
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
MEF2
YJL102W
2460 nt
4.23
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
YLR152C
YLR152C
1731 nt
4.23
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
SDS23
YGL056C
1584 nt
4.23
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
MON1
YGL124C
1935 nt
4.23
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
PMT4
YJR143C
2289 nt
4.23
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
MPS3
YJL019W
2049 nt
4.22
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
ARN2
YHL047C
1863 nt
4.22
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
CRT10
YOL063C
2874 nt
4.22
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
ERV1
YGR029W
570 nt
4.22
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
VPS63
YLR261C
327 nt
4.22
□□□□□ -1.73
ROT1
Q03691
RIO2
YNL207W
1278 nt
4.22
□□□□□ -1.73
First
Previous
47
Next
Last
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 77.6 ms