Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 YDR124WYDR124W 975 nt3.24□□□□□ -1.89
SEC28P40509 APA2YDR530C 978 nt3.24□□□□□ -1.89
SEC28P40509 MEI4YER044C-A 1227 nt3.24□□□□□ -1.89
SEC28P40509 COBQ0105 1158 nt3.24□□□□□ -1.89
SEC28P40509 YER165C-AYER165C-A 357 nt3.24□□□□□ -1.89
SEC28P40509 RPA12YJR063W 378 nt3.24□□□□□ -1.89
SEC28P40509 AIM26YKL037W 357 nt3.24□□□□□ -1.89
SEC28P40509 RPL17AYKL180W 555 nt3.24□□□□□ -1.89
SEC28P40509 SAM37YMR060C 984 nt3.24□□□□□ -1.89
SEC28P40509 PEX15YOL044W 1152 nt3.24□□□□□ -1.89
SEC28P40509 YOL114CYOL114C 609 nt3.24□□□□□ -1.89
SEC28P40509 DPB3YBR278W 606 nt3.24□□□□□ -1.89
SEC28P40509 CIK1YMR198W 1785 nt3.24□□□□□ -1.89
SEC28P40509 BI3Q0115 1554 nt3.24□□□□□ -1.89
SEC28P40509 VAS1YGR094W 3315 nt3.24□□□□□ -1.89
SEC28P40509 YSP2YDR326C 4317 nt3.23□□□□□ -1.89
SEC28P40509 ROM1YGR070W 3468 nt3.23□□□□□ -1.89
SEC28P40509 SPO71YDR104C 3738 nt3.23□□□□□ -1.89
SEC28P40509 BUD26YDR241W 288 nt3.23□□□□□ -1.89
SEC28P40509 FYV6YNL133C 522 nt3.23□□□□□ -1.89
SEC28P40509 FMP41YNL168C 780 nt3.23□□□□□ -1.89
SEC28P40509 IRC13YOR235W 315 nt3.23□□□□□ -1.89
SEC28P40509 TFB6YOR352W 1032 nt3.23□□□□□ -1.89
SEC28P40509 TAF2YCR042C 4224 nt3.23□□□□□ -1.89
SEC28P40509 SRP68YPL243W 1800 nt3.23□□□□□ -1.89
SEC28P40509 YDL180WYDL180W 1644 nt3.22□□□□□ -1.89
SEC28P40509 CMK1YFR014C 1341 nt3.22□□□□□ -1.89
SEC28P40509 DOA4YDR069C 2781 nt3.22□□□□□ -1.89
SEC28P40509 snR68snR68 136 nt3.22□□□□□ -1.89
SEC28P40509 RTT105YER104W 627 nt3.22□□□□□ -1.89
SEC28P40509 RPL30YGL030W 318 nt3.22□□□□□ -1.89
SEC28P40509 YGL177WYGL177W 348 nt3.22□□□□□ -1.89
SEC28P40509 UPF3YGR072W 1164 nt3.22□□□□□ -1.89
SEC28P40509 HTD2YHR067W 843 nt3.22□□□□□ -1.89
SEC28P40509 DLS1YJL065C 504 nt3.22□□□□□ -1.89
SEC28P40509 YLR076CYLR076C 423 nt3.22□□□□□ -1.89
SEC28P40509 YML090WYML090W 387 nt3.22□□□□□ -1.89
SEC28P40509 RHO5YNL180C 996 nt3.22□□□□□ -1.89
SEC28P40509 MCA1YOR197W 1299 nt3.22□□□□□ -1.89
SEC28P40509 LTP1YPR073C 486 nt3.22□□□□□ -1.89
SEC28P40509 AI4Q0065 1671 nt3.22□□□□□ -1.89
SEC28P40509 TIF4631YGR162W 2859 nt3.22□□□□□ -1.89
SEC28P40509 TDA1YMR291W 1761 nt3.22□□□□□ -1.89
SEC28P40509 BNI4YNL233W 2679 nt3.22□□□□□ -1.89
SEC28P40509 YPS6YIR039C 1614 nt3.22□□□□□ -1.89
SEC28P40509 EXO84YBR102C 2262 nt3.22□□□□□ -1.89
SEC28P40509 YNR063WYNR063W 1824 nt3.21□□□□□ -1.89
SEC28P40509 UBC9YDL064W 474 nt3.21□□□□□ -1.9
SEC28P40509 YDR133CYDR133C 336 nt3.21□□□□□ -1.9
SEC28P40509 USE1YGL098W 738 nt3.21□□□□□ -1.9
SEC28P40509 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt3.21□□□□□ -1.9
SEC28P40509 CSM3YMR048W 954 nt3.21□□□□□ -1.9
SEC28P40509 TPT1YOL102C 693 nt3.21□□□□□ -1.9
SEC28P40509 SRL1YOR247W 633 nt3.21□□□□□ -1.9
SEC28P40509 NIP7YPL211W 546 nt3.21□□□□□ -1.9
SEC28P40509 ARP4YJL081C 1470 nt3.21□□□□□ -1.9
SEC28P40509 DIA2YOR080W 2199 nt3.21□□□□□ -1.9
SEC28P40509 PEX6YNL329C 3093 nt3.2□□□□□ -1.9
SEC28P40509 FMP32YFL046W 624 nt3.2□□□□□ -1.9
SEC28P40509 CDC26YFR036W 375 nt3.2□□□□□ -1.9
SEC28P40509 NNF1YJR112W 606 nt3.2□□□□□ -1.9
SEC28P40509 BOS1YLR078C 735 nt3.2□□□□□ -1.9
SEC28P40509 YBR013CYBR013C 390 nt3.2□□□□□ -1.9
SEC28P40509 DUF1YOL087C 3351 nt3.2□□□□□ -1.9
SEC28P40509 RCY1YJL204C 2523 nt3.2□□□□□ -1.9
SEC28P40509 NOP4YPL043W 2058 nt3.2□□□□□ -1.9
SEC28P40509 YDR442WYDR442W 393 nt3.19□□□□□ -1.9
SEC28P40509 TCA17YEL048C 459 nt3.19□□□□□ -1.9
SEC28P40509 RPB9YGL070C 369 nt3.19□□□□□ -1.9
SEC28P40509 YBL065WYBL065W 345 nt3.19□□□□□ -1.9
SEC28P40509 EPL1YFL024C 2499 nt3.19□□□□□ -1.9
SEC28P40509 PCI8YIL071C 1335 nt3.19□□□□□ -1.9
SEC28P40509 HBT1YDL223C 3141 nt3.18□□□□□ -1.9
SEC28P40509 EAP1YKL204W 1899 nt3.18□□□□□ -1.9
SEC28P40509 AI3Q0060 1248 nt3.18□□□□□ -1.9
SEC28P40509 MFA1YDR461W 111 nt3.18□□□□□ -1.9
SEC28P40509 YML094C-AYML094C-A 402 nt3.18□□□□□ -1.9
SEC28P40509 YMR099CYMR099C 894 nt3.18□□□□□ -1.9
SEC28P40509 YOR387CYOR387C 621 nt3.18□□□□□ -1.9
SEC28P40509 CHS2YBR038W 2892 nt3.18□□□□□ -1.9
SEC28P40509 POL4YCR014C 1749 nt3.18□□□□□ -1.9
SEC28P40509 MDM1YML104C 3384 nt3.18□□□□□ -1.9
SEC28P40509 YAT2YER024W 2772 nt3.17□□□□□ -1.9
SEC28P40509 AVT5YBL089W 1380 nt3.17□□□□□ -1.9
SEC28P40509 OPI6YDL096C 327 nt3.17□□□□□ -1.9
SEC28P40509 RMT2YDR465C 1239 nt3.17□□□□□ -1.9
SEC28P40509 PSF2YJL072C 642 nt3.17□□□□□ -1.9
SEC28P40509 CCE1YKL011C 1062 nt3.17□□□□□ -1.9
SEC28P40509 UNG1YML021C 1080 nt3.17□□□□□ -1.9
SEC28P40509 MTG1YMR097C 1104 nt3.17□□□□□ -1.9
SEC28P40509 TSR4YOL022C 1227 nt3.17□□□□□ -1.9
SEC28P40509 UBS1YBR165W 834 nt3.17□□□□□ -1.9
SEC28P40509 RIX1YHR197W 2292 nt3.17□□□□□ -1.9
SEC28P40509 RPN1YHR027C 2982 nt3.16□□□□□ -1.9
SEC28P40509 YCR016WYCR016W 873 nt3.16□□□□□ -1.9
SEC28P40509 RPL13AYDL082W 600 nt3.16□□□□□ -1.9
SEC28P40509 FMN1YDR236C 657 nt3.16□□□□□ -1.9
SEC28P40509 YER066C-AYER066C-A 501 nt3.16□□□□□ -1.9
SEC28P40509 MRPL9YGR220C 810 nt3.16□□□□□ -1.9
SEC28P40509 AGE2YIL044C 897 nt3.16□□□□□ -1.9
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