Protein–RNA interactions for Protein: O94761

RECQL4, ATP-dependent DNA helicase Q4, humanhuman

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQL4O94761 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RECQL4O94761 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RECQL4O94761 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RECQL4O94761 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RECQL4O94761 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 908.9 ms