Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDD3Q9Y3P4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDD3Q9Y3P4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDD3Q9Y3P4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDD3Q9Y3P4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDD3Q9Y3P4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDD3Q9Y3P4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDD3Q9Y3P4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RHBDD3Q9Y3P4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDD3Q9Y3P4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDD3Q9Y3P4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDD3Q9Y3P4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDD3Q9Y3P4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDD3Q9Y3P4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDD3Q9Y3P4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDD3Q9Y3P4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDD3Q9Y3P4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDD3Q9Y3P4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDD3Q9Y3P4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDD3Q9Y3P4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDD3Q9Y3P4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDD3Q9Y3P4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDD3Q9Y3P4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDD3Q9Y3P4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RHBDD3Q9Y3P4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RHBDD3Q9Y3P4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms