Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATP8A1Q9Y2Q0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP8A1Q9Y2Q0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms