Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SETD1BQ9UPS6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SETD1BQ9UPS6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SETD1BQ9UPS6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
SETD1BQ9UPS6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
SETD1BQ9UPS6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
SETD1BQ9UPS6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
SETD1BQ9UPS6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC31■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
SETD1BQ9UPS6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SETD1BQ9UPS6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
SETD1BQ9UPS6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
SETD1BQ9UPS6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SETD1BQ9UPS6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
SETD1BQ9UPS6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
SETD1BQ9UPS6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SETD1BQ9UPS6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SETD1BQ9UPS6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SETD1BQ9UPS6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SETD1BQ9UPS6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SETD1BQ9UPS6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SETD1BQ9UPS6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SETD1BQ9UPS6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SETD1BQ9UPS6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SETD1BQ9UPS6 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SETD1BQ9UPS6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SETD1BQ9UPS6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SETD1BQ9UPS6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SETD1BQ9UPS6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SETD1BQ9UPS6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
SETD1BQ9UPS6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SETD1BQ9UPS6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
SETD1BQ9UPS6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SETD1BQ9UPS6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SETD1BQ9UPS6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SETD1BQ9UPS6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SETD1BQ9UPS6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
SETD1BQ9UPS6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SETD1BQ9UPS6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SETD1BQ9UPS6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SETD1BQ9UPS6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SETD1BQ9UPS6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SETD1BQ9UPS6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SETD1BQ9UPS6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SETD1BQ9UPS6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SETD1BQ9UPS6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
SETD1BQ9UPS6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SETD1BQ9UPS6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SETD1BQ9UPS6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SETD1BQ9UPS6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SETD1BQ9UPS6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SETD1BQ9UPS6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SETD1BQ9UPS6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms