Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC17A6Q9P2U8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms