Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3CQ99985 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms