Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PFDN5Q99471 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PFDN5Q99471 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PFDN5Q99471 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PFDN5Q99471 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PFDN5Q99471 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PFDN5Q99471 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PFDN5Q99471 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PFDN5Q99471 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PFDN5Q99471 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PFDN5Q99471 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PFDN5Q99471 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PFDN5Q99471 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PFDN5Q99471 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PFDN5Q99471 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PFDN5Q99471 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PFDN5Q99471 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PFDN5Q99471 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PFDN5Q99471 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PFDN5Q99471 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PFDN5Q99471 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PFDN5Q99471 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PFDN5Q99471 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PFDN5Q99471 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PFDN5Q99471 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PFDN5Q99471 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PFDN5Q99471 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PFDN5Q99471 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PFDN5Q99471 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PFDN5Q99471 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PFDN5Q99471 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms