Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BHLHA9Q7RTU4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BHLHA9Q7RTU4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms