Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUM4

ARHGAP27, Rho GTPase-activating protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP27Q6ZUM4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARHGAP27Q6ZUM4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARHGAP27Q6ZUM4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARHGAP27Q6ZUM4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ARHGAP27Q6ZUM4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ARHGAP27Q6ZUM4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ARHGAP27Q6ZUM4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ARHGAP27Q6ZUM4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ARHGAP27Q6ZUM4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARHGAP27Q6ZUM4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARHGAP27Q6ZUM4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARHGAP27Q6ZUM4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARHGAP27Q6ZUM4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARHGAP27Q6ZUM4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARHGAP27Q6ZUM4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARHGAP27Q6ZUM4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARHGAP27Q6ZUM4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARHGAP27Q6ZUM4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARHGAP27Q6ZUM4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARHGAP27Q6ZUM4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ARHGAP27Q6ZUM4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARHGAP27Q6ZUM4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARHGAP27Q6ZUM4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARHGAP27Q6ZUM4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms